Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD62

CTR9, RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTR9Q6PD62 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CTR9Q6PD62 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CTR9Q6PD62 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CTR9Q6PD62 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CTR9Q6PD62 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CTR9Q6PD62 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CTR9Q6PD62 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CTR9Q6PD62 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CTR9Q6PD62 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CTR9Q6PD62 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CTR9Q6PD62 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CTR9Q6PD62 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CTR9Q6PD62 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CTR9Q6PD62 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CTR9Q6PD62 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CTR9Q6PD62 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CTR9Q6PD62 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CTR9Q6PD62 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CTR9Q6PD62 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CTR9Q6PD62 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CTR9Q6PD62 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CTR9Q6PD62 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CTR9Q6PD62 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CTR9Q6PD62 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CTR9Q6PD62 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CTR9Q6PD62 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CTR9Q6PD62 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CTR9Q6PD62 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CTR9Q6PD62 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CTR9Q6PD62 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CTR9Q6PD62 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CTR9Q6PD62 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CTR9Q6PD62 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CTR9Q6PD62 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CTR9Q6PD62 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CTR9Q6PD62 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CTR9Q6PD62 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CTR9Q6PD62 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CTR9Q6PD62 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CTR9Q6PD62 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CTR9Q6PD62 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CTR9Q6PD62 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CTR9Q6PD62 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CTR9Q6PD62 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CTR9Q6PD62 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CTR9Q6PD62 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CTR9Q6PD62 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CTR9Q6PD62 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CTR9Q6PD62 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CTR9Q6PD62 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CTR9Q6PD62 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CTR9Q6PD62 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CTR9Q6PD62 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CTR9Q6PD62 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CTR9Q6PD62 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CTR9Q6PD62 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CTR9Q6PD62 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CTR9Q6PD62 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CTR9Q6PD62 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CTR9Q6PD62 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CTR9Q6PD62 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CTR9Q6PD62 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CTR9Q6PD62 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CTR9Q6PD62 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CTR9Q6PD62 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CTR9Q6PD62 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CTR9Q6PD62 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CTR9Q6PD62 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CTR9Q6PD62 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CTR9Q6PD62 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CTR9Q6PD62 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CTR9Q6PD62 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CTR9Q6PD62 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CTR9Q6PD62 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CTR9Q6PD62 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CTR9Q6PD62 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CTR9Q6PD62 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CTR9Q6PD62 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CTR9Q6PD62 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CTR9Q6PD62 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CTR9Q6PD62 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CTR9Q6PD62 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CTR9Q6PD62 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CTR9Q6PD62 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CTR9Q6PD62 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CTR9Q6PD62 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CTR9Q6PD62 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CTR9Q6PD62 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CTR9Q6PD62 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CTR9Q6PD62 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CTR9Q6PD62 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CTR9Q6PD62 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CTR9Q6PD62 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CTR9Q6PD62 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CTR9Q6PD62 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CTR9Q6PD62 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CTR9Q6PD62 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CTR9Q6PD62 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CTR9Q6PD62 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CTR9Q6PD62 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms