Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5X5

C22orf39, UPF0545 protein C22orf39, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C22orf39Q6P5X5 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C22orf39Q6P5X5 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C22orf39Q6P5X5 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C22orf39Q6P5X5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C22orf39Q6P5X5 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C22orf39Q6P5X5 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C22orf39Q6P5X5 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C22orf39Q6P5X5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C22orf39Q6P5X5 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C22orf39Q6P5X5 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C22orf39Q6P5X5 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
C22orf39Q6P5X5 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C22orf39Q6P5X5 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C22orf39Q6P5X5 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C22orf39Q6P5X5 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
C22orf39Q6P5X5 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C22orf39Q6P5X5 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C22orf39Q6P5X5 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C22orf39Q6P5X5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C22orf39Q6P5X5 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C22orf39Q6P5X5 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C22orf39Q6P5X5 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C22orf39Q6P5X5 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C22orf39Q6P5X5 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C22orf39Q6P5X5 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C22orf39Q6P5X5 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C22orf39Q6P5X5 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C22orf39Q6P5X5 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C22orf39Q6P5X5 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
C22orf39Q6P5X5 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C22orf39Q6P5X5 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C22orf39Q6P5X5 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
C22orf39Q6P5X5 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C22orf39Q6P5X5 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C22orf39Q6P5X5 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C22orf39Q6P5X5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C22orf39Q6P5X5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C22orf39Q6P5X5 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C22orf39Q6P5X5 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C22orf39Q6P5X5 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C22orf39Q6P5X5 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C22orf39Q6P5X5 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C22orf39Q6P5X5 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C22orf39Q6P5X5 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C22orf39Q6P5X5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C22orf39Q6P5X5 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C22orf39Q6P5X5 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C22orf39Q6P5X5 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C22orf39Q6P5X5 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C22orf39Q6P5X5 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C22orf39Q6P5X5 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C22orf39Q6P5X5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C22orf39Q6P5X5 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C22orf39Q6P5X5 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C22orf39Q6P5X5 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
C22orf39Q6P5X5 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C22orf39Q6P5X5 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C22orf39Q6P5X5 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
C22orf39Q6P5X5 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C22orf39Q6P5X5 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C22orf39Q6P5X5 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C22orf39Q6P5X5 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C22orf39Q6P5X5 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C22orf39Q6P5X5 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C22orf39Q6P5X5 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C22orf39Q6P5X5 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C22orf39Q6P5X5 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C22orf39Q6P5X5 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C22orf39Q6P5X5 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C22orf39Q6P5X5 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C22orf39Q6P5X5 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C22orf39Q6P5X5 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C22orf39Q6P5X5 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C22orf39Q6P5X5 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
C22orf39Q6P5X5 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C22orf39Q6P5X5 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C22orf39Q6P5X5 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C22orf39Q6P5X5 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C22orf39Q6P5X5 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C22orf39Q6P5X5 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C22orf39Q6P5X5 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C22orf39Q6P5X5 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C22orf39Q6P5X5 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C22orf39Q6P5X5 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
C22orf39Q6P5X5 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C22orf39Q6P5X5 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C22orf39Q6P5X5 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C22orf39Q6P5X5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C22orf39Q6P5X5 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C22orf39Q6P5X5 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C22orf39Q6P5X5 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C22orf39Q6P5X5 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C22orf39Q6P5X5 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C22orf39Q6P5X5 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C22orf39Q6P5X5 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C22orf39Q6P5X5 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C22orf39Q6P5X5 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C22orf39Q6P5X5 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C22orf39Q6P5X5 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C22orf39Q6P5X5 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms