Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4E1

CASC4, Protein CASC4, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC4Q6P4E1 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASC4Q6P4E1 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASC4Q6P4E1 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASC4Q6P4E1 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASC4Q6P4E1 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASC4Q6P4E1 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASC4Q6P4E1 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASC4Q6P4E1 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASC4Q6P4E1 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASC4Q6P4E1 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASC4Q6P4E1 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASC4Q6P4E1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASC4Q6P4E1 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASC4Q6P4E1 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASC4Q6P4E1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASC4Q6P4E1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASC4Q6P4E1 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASC4Q6P4E1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASC4Q6P4E1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASC4Q6P4E1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASC4Q6P4E1 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASC4Q6P4E1 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASC4Q6P4E1 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASC4Q6P4E1 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CASC4Q6P4E1 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CASC4Q6P4E1 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CASC4Q6P4E1 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CASC4Q6P4E1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CASC4Q6P4E1 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CASC4Q6P4E1 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CASC4Q6P4E1 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CASC4Q6P4E1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CASC4Q6P4E1 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CASC4Q6P4E1 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CASC4Q6P4E1 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CASC4Q6P4E1 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASC4Q6P4E1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASC4Q6P4E1 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASC4Q6P4E1 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CASC4Q6P4E1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASC4Q6P4E1 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASC4Q6P4E1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CASC4Q6P4E1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASC4Q6P4E1 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASC4Q6P4E1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASC4Q6P4E1 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASC4Q6P4E1 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASC4Q6P4E1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASC4Q6P4E1 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASC4Q6P4E1 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASC4Q6P4E1 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASC4Q6P4E1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASC4Q6P4E1 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASC4Q6P4E1 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASC4Q6P4E1 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASC4Q6P4E1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASC4Q6P4E1 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASC4Q6P4E1 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASC4Q6P4E1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASC4Q6P4E1 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASC4Q6P4E1 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CASC4Q6P4E1 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASC4Q6P4E1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASC4Q6P4E1 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASC4Q6P4E1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASC4Q6P4E1 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASC4Q6P4E1 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASC4Q6P4E1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASC4Q6P4E1 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CASC4Q6P4E1 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASC4Q6P4E1 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASC4Q6P4E1 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASC4Q6P4E1 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASC4Q6P4E1 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASC4Q6P4E1 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASC4Q6P4E1 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASC4Q6P4E1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASC4Q6P4E1 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASC4Q6P4E1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASC4Q6P4E1 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASC4Q6P4E1 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASC4Q6P4E1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASC4Q6P4E1 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASC4Q6P4E1 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASC4Q6P4E1 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASC4Q6P4E1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASC4Q6P4E1 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASC4Q6P4E1 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASC4Q6P4E1 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASC4Q6P4E1 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASC4Q6P4E1 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASC4Q6P4E1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASC4Q6P4E1 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASC4Q6P4E1 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASC4Q6P4E1 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASC4Q6P4E1 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASC4Q6P4E1 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASC4Q6P4E1 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASC4Q6P4E1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASC4Q6P4E1 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms