Protein–RNA interactions for Protein: Q6P435

Putative uncharacterized SMG1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P435 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q6P435 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q6P435 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q6P435 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q6P435 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q6P435 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Q6P435 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q6P435 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q6P435 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q6P435 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q6P435 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q6P435 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q6P435 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q6P435 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q6P435 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q6P435 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q6P435 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q6P435 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Q6P435 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q6P435 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q6P435 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q6P435 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q6P435 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q6P435 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q6P435 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q6P435 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q6P435 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q6P435 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q6P435 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q6P435 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q6P435 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q6P435 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q6P435 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q6P435 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q6P435 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q6P435 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q6P435 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q6P435 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q6P435 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q6P435 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q6P435 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q6P435 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q6P435 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q6P435 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q6P435 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q6P435 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q6P435 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q6P435 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q6P435 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q6P435 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q6P435 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q6P435 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q6P435 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Q6P435 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q6P435 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q6P435 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q6P435 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q6P435 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Q6P435 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q6P435 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q6P435 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q6P435 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q6P435 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q6P435 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q6P435 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q6P435 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q6P435 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q6P435 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q6P435 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Q6P435 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q6P435 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q6P435 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q6P435 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q6P435 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Q6P435 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Q6P435 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Q6P435 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q6P435 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q6P435 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q6P435 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q6P435 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q6P435 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q6P435 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q6P435 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q6P435 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q6P435 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q6P435 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Q6P435 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q6P435 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q6P435 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Q6P435 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Q6P435 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Q6P435 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Q6P435 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Q6P435 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q6P435 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q6P435 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q6P435 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q6P435 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q6P435 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms