Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTE8

MRNIP, MRN complex-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRNIPQ6NTE8 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MRNIPQ6NTE8 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MRNIPQ6NTE8 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MRNIPQ6NTE8 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MRNIPQ6NTE8 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MRNIPQ6NTE8 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MRNIPQ6NTE8 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MRNIPQ6NTE8 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MRNIPQ6NTE8 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MRNIPQ6NTE8 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MRNIPQ6NTE8 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MRNIPQ6NTE8 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MRNIPQ6NTE8 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MRNIPQ6NTE8 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MRNIPQ6NTE8 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MRNIPQ6NTE8 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MRNIPQ6NTE8 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MRNIPQ6NTE8 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MRNIPQ6NTE8 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MRNIPQ6NTE8 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MRNIPQ6NTE8 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MRNIPQ6NTE8 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
MRNIPQ6NTE8 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MRNIPQ6NTE8 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MRNIPQ6NTE8 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
MRNIPQ6NTE8 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
MRNIPQ6NTE8 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
MRNIPQ6NTE8 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
MRNIPQ6NTE8 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MRNIPQ6NTE8 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MRNIPQ6NTE8 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MRNIPQ6NTE8 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MRNIPQ6NTE8 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MRNIPQ6NTE8 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MRNIPQ6NTE8 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MRNIPQ6NTE8 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MRNIPQ6NTE8 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MRNIPQ6NTE8 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MRNIPQ6NTE8 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MRNIPQ6NTE8 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MRNIPQ6NTE8 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
MRNIPQ6NTE8 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MRNIPQ6NTE8 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
MRNIPQ6NTE8 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
MRNIPQ6NTE8 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
MRNIPQ6NTE8 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
MRNIPQ6NTE8 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MRNIPQ6NTE8 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MRNIPQ6NTE8 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MRNIPQ6NTE8 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MRNIPQ6NTE8 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MRNIPQ6NTE8 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
MRNIPQ6NTE8 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MRNIPQ6NTE8 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MRNIPQ6NTE8 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MRNIPQ6NTE8 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MRNIPQ6NTE8 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MRNIPQ6NTE8 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MRNIPQ6NTE8 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MRNIPQ6NTE8 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MRNIPQ6NTE8 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MRNIPQ6NTE8 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MRNIPQ6NTE8 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MRNIPQ6NTE8 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MRNIPQ6NTE8 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MRNIPQ6NTE8 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MRNIPQ6NTE8 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MRNIPQ6NTE8 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MRNIPQ6NTE8 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MRNIPQ6NTE8 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MRNIPQ6NTE8 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MRNIPQ6NTE8 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MRNIPQ6NTE8 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MRNIPQ6NTE8 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MRNIPQ6NTE8 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MRNIPQ6NTE8 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MRNIPQ6NTE8 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MRNIPQ6NTE8 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MRNIPQ6NTE8 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MRNIPQ6NTE8 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MRNIPQ6NTE8 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MRNIPQ6NTE8 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MRNIPQ6NTE8 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MRNIPQ6NTE8 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MRNIPQ6NTE8 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MRNIPQ6NTE8 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MRNIPQ6NTE8 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MRNIPQ6NTE8 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MRNIPQ6NTE8 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MRNIPQ6NTE8 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MRNIPQ6NTE8 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MRNIPQ6NTE8 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MRNIPQ6NTE8 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MRNIPQ6NTE8 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MRNIPQ6NTE8 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MRNIPQ6NTE8 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MRNIPQ6NTE8 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MRNIPQ6NTE8 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MRNIPQ6NTE8 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MRNIPQ6NTE8 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms