Protein–RNA interactions for Protein: Q6JBY9

RCSD1, CapZ-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCSD1Q6JBY9 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RCSD1Q6JBY9 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RCSD1Q6JBY9 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RCSD1Q6JBY9 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RCSD1Q6JBY9 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RCSD1Q6JBY9 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RCSD1Q6JBY9 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RCSD1Q6JBY9 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RCSD1Q6JBY9 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RCSD1Q6JBY9 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RCSD1Q6JBY9 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RCSD1Q6JBY9 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RCSD1Q6JBY9 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RCSD1Q6JBY9 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RCSD1Q6JBY9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RCSD1Q6JBY9 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RCSD1Q6JBY9 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RCSD1Q6JBY9 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RCSD1Q6JBY9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RCSD1Q6JBY9 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RCSD1Q6JBY9 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RCSD1Q6JBY9 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RCSD1Q6JBY9 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RCSD1Q6JBY9 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RCSD1Q6JBY9 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RCSD1Q6JBY9 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RCSD1Q6JBY9 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RCSD1Q6JBY9 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RCSD1Q6JBY9 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RCSD1Q6JBY9 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
RCSD1Q6JBY9 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RCSD1Q6JBY9 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RCSD1Q6JBY9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RCSD1Q6JBY9 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RCSD1Q6JBY9 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RCSD1Q6JBY9 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RCSD1Q6JBY9 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RCSD1Q6JBY9 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RCSD1Q6JBY9 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RCSD1Q6JBY9 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RCSD1Q6JBY9 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RCSD1Q6JBY9 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
RCSD1Q6JBY9 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RCSD1Q6JBY9 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RCSD1Q6JBY9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RCSD1Q6JBY9 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RCSD1Q6JBY9 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RCSD1Q6JBY9 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RCSD1Q6JBY9 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RCSD1Q6JBY9 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RCSD1Q6JBY9 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RCSD1Q6JBY9 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RCSD1Q6JBY9 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RCSD1Q6JBY9 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RCSD1Q6JBY9 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RCSD1Q6JBY9 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RCSD1Q6JBY9 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RCSD1Q6JBY9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RCSD1Q6JBY9 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RCSD1Q6JBY9 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RCSD1Q6JBY9 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RCSD1Q6JBY9 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RCSD1Q6JBY9 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RCSD1Q6JBY9 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RCSD1Q6JBY9 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RCSD1Q6JBY9 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RCSD1Q6JBY9 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RCSD1Q6JBY9 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RCSD1Q6JBY9 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RCSD1Q6JBY9 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RCSD1Q6JBY9 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
RCSD1Q6JBY9 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
RCSD1Q6JBY9 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RCSD1Q6JBY9 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RCSD1Q6JBY9 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RCSD1Q6JBY9 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RCSD1Q6JBY9 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
RCSD1Q6JBY9 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RCSD1Q6JBY9 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RCSD1Q6JBY9 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RCSD1Q6JBY9 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RCSD1Q6JBY9 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RCSD1Q6JBY9 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RCSD1Q6JBY9 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RCSD1Q6JBY9 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RCSD1Q6JBY9 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RCSD1Q6JBY9 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RCSD1Q6JBY9 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RCSD1Q6JBY9 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RCSD1Q6JBY9 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RCSD1Q6JBY9 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RCSD1Q6JBY9 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RCSD1Q6JBY9 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RCSD1Q6JBY9 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RCSD1Q6JBY9 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RCSD1Q6JBY9 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RCSD1Q6JBY9 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
RCSD1Q6JBY9 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RCSD1Q6JBY9 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RCSD1Q6JBY9 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms