Protein–RNA interactions for Protein: Q6GYQ0

RALGAPA1, Ral GTPase-activating protein subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 2,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGAPA1Q6GYQ0 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RALGAPA1Q6GYQ0 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
RALGAPA1Q6GYQ0 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RALGAPA1Q6GYQ0 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
RALGAPA1Q6GYQ0 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
RALGAPA1Q6GYQ0 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RALGAPA1Q6GYQ0 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RALGAPA1Q6GYQ0 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RALGAPA1Q6GYQ0 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RALGAPA1Q6GYQ0 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RALGAPA1Q6GYQ0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RALGAPA1Q6GYQ0 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RALGAPA1Q6GYQ0 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RALGAPA1Q6GYQ0 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RALGAPA1Q6GYQ0 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RALGAPA1Q6GYQ0 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RALGAPA1Q6GYQ0 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RALGAPA1Q6GYQ0 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RALGAPA1Q6GYQ0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RALGAPA1Q6GYQ0 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RALGAPA1Q6GYQ0 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RALGAPA1Q6GYQ0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RALGAPA1Q6GYQ0 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RALGAPA1Q6GYQ0 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
RALGAPA1Q6GYQ0 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RALGAPA1Q6GYQ0 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RALGAPA1Q6GYQ0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RALGAPA1Q6GYQ0 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RALGAPA1Q6GYQ0 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RALGAPA1Q6GYQ0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RALGAPA1Q6GYQ0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
RALGAPA1Q6GYQ0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RALGAPA1Q6GYQ0 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RALGAPA1Q6GYQ0 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
RALGAPA1Q6GYQ0 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
RALGAPA1Q6GYQ0 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RALGAPA1Q6GYQ0 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RALGAPA1Q6GYQ0 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RALGAPA1Q6GYQ0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RALGAPA1Q6GYQ0 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RALGAPA1Q6GYQ0 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RALGAPA1Q6GYQ0 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RALGAPA1Q6GYQ0 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RALGAPA1Q6GYQ0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RALGAPA1Q6GYQ0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RALGAPA1Q6GYQ0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RALGAPA1Q6GYQ0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RALGAPA1Q6GYQ0 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RALGAPA1Q6GYQ0 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RALGAPA1Q6GYQ0 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
RALGAPA1Q6GYQ0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RALGAPA1Q6GYQ0 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RALGAPA1Q6GYQ0 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RALGAPA1Q6GYQ0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RALGAPA1Q6GYQ0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RALGAPA1Q6GYQ0 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RALGAPA1Q6GYQ0 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
RALGAPA1Q6GYQ0 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RALGAPA1Q6GYQ0 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RALGAPA1Q6GYQ0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RALGAPA1Q6GYQ0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RALGAPA1Q6GYQ0 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RALGAPA1Q6GYQ0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RALGAPA1Q6GYQ0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RALGAPA1Q6GYQ0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RALGAPA1Q6GYQ0 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RALGAPA1Q6GYQ0 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RALGAPA1Q6GYQ0 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RALGAPA1Q6GYQ0 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RALGAPA1Q6GYQ0 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RALGAPA1Q6GYQ0 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RALGAPA1Q6GYQ0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RALGAPA1Q6GYQ0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RALGAPA1Q6GYQ0 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RALGAPA1Q6GYQ0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RALGAPA1Q6GYQ0 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RALGAPA1Q6GYQ0 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RALGAPA1Q6GYQ0 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RALGAPA1Q6GYQ0 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RALGAPA1Q6GYQ0 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RALGAPA1Q6GYQ0 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RALGAPA1Q6GYQ0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RALGAPA1Q6GYQ0 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RALGAPA1Q6GYQ0 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
RALGAPA1Q6GYQ0 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RALGAPA1Q6GYQ0 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RALGAPA1Q6GYQ0 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RALGAPA1Q6GYQ0 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RALGAPA1Q6GYQ0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
RALGAPA1Q6GYQ0 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RALGAPA1Q6GYQ0 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RALGAPA1Q6GYQ0 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RALGAPA1Q6GYQ0 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
RALGAPA1Q6GYQ0 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RALGAPA1Q6GYQ0 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RALGAPA1Q6GYQ0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RALGAPA1Q6GYQ0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RALGAPA1Q6GYQ0 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RALGAPA1Q6GYQ0 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RALGAPA1Q6GYQ0 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms