Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC35.33■■■■□ 3.25
CARMIL2Q6F5E8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
CARMIL2Q6F5E8 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
CARMIL2Q6F5E8 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
CARMIL2Q6F5E8 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.25
CARMIL2Q6F5E8 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.25
CARMIL2Q6F5E8 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.25
CARMIL2Q6F5E8 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.25
CARMIL2Q6F5E8 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.25
CARMIL2Q6F5E8 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
CARMIL2Q6F5E8 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
CARMIL2Q6F5E8 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC35.32■■■■□ 3.24
CARMIL2Q6F5E8 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC35.32■■■■□ 3.24
CARMIL2Q6F5E8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
CARMIL2Q6F5E8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
CARMIL2Q6F5E8 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
CARMIL2Q6F5E8 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
CARMIL2Q6F5E8 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
CARMIL2Q6F5E8 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC35.31■■■■□ 3.24
CARMIL2Q6F5E8 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC35.31■■■■□ 3.24
CARMIL2Q6F5E8 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
CARMIL2Q6F5E8 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
CARMIL2Q6F5E8 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
CARMIL2Q6F5E8 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
CARMIL2Q6F5E8 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
CARMIL2Q6F5E8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
CARMIL2Q6F5E8 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
CARMIL2Q6F5E8 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
CARMIL2Q6F5E8 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
CARMIL2Q6F5E8 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
CARMIL2Q6F5E8 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
CARMIL2Q6F5E8 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.29■■■■□ 3.24
CARMIL2Q6F5E8 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
CARMIL2Q6F5E8 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC35.29■■■■□ 3.24
CARMIL2Q6F5E8 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
CARMIL2Q6F5E8 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
CARMIL2Q6F5E8 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
CARMIL2Q6F5E8 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
CARMIL2Q6F5E8 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC35.28■■■■□ 3.24
CARMIL2Q6F5E8 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
CARMIL2Q6F5E8 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
CARMIL2Q6F5E8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC35.28■■■■□ 3.24
CARMIL2Q6F5E8 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
CARMIL2Q6F5E8 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
CARMIL2Q6F5E8 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
CARMIL2Q6F5E8 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC35.27■■■■□ 3.24
CARMIL2Q6F5E8 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC35.27■■■■□ 3.24
CARMIL2Q6F5E8 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC35.27■■■■□ 3.24
CARMIL2Q6F5E8 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.27■■■■□ 3.24
CARMIL2Q6F5E8 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
CARMIL2Q6F5E8 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
CARMIL2Q6F5E8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
CARMIL2Q6F5E8 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.24
CARMIL2Q6F5E8 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.24
CARMIL2Q6F5E8 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC35.26■■■■□ 3.24
CARMIL2Q6F5E8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
CARMIL2Q6F5E8 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
CARMIL2Q6F5E8 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.23
CARMIL2Q6F5E8 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
CARMIL2Q6F5E8 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
CARMIL2Q6F5E8 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
CARMIL2Q6F5E8 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
CARMIL2Q6F5E8 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC35.25■■■■□ 3.23
CARMIL2Q6F5E8 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
CARMIL2Q6F5E8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
CARMIL2Q6F5E8 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
CARMIL2Q6F5E8 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
CARMIL2Q6F5E8 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
CARMIL2Q6F5E8 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC35.24■■■■□ 3.23
CARMIL2Q6F5E8 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
CARMIL2Q6F5E8 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
CARMIL2Q6F5E8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
CARMIL2Q6F5E8 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC35.23■■■■□ 3.23
CARMIL2Q6F5E8 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
CARMIL2Q6F5E8 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
CARMIL2Q6F5E8 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
CARMIL2Q6F5E8 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
CARMIL2Q6F5E8 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
CARMIL2Q6F5E8 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
CARMIL2Q6F5E8 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
CARMIL2Q6F5E8 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
CARMIL2Q6F5E8 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
CARMIL2Q6F5E8 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
CARMIL2Q6F5E8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
CARMIL2Q6F5E8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
CARMIL2Q6F5E8 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
CARMIL2Q6F5E8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
CARMIL2Q6F5E8 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
CARMIL2Q6F5E8 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
CARMIL2Q6F5E8 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
CARMIL2Q6F5E8 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
CARMIL2Q6F5E8 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
CARMIL2Q6F5E8 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
CARMIL2Q6F5E8 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
CARMIL2Q6F5E8 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
CARMIL2Q6F5E8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
CARMIL2Q6F5E8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
CARMIL2Q6F5E8 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
CARMIL2Q6F5E8 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC35.21■■■■□ 3.23
CARMIL2Q6F5E8 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms