Protein–RNA interactions for Protein: Q68D86

CCDC102B, Coiled-coil domain-containing protein 102B, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC102BQ68D86 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC102BQ68D86 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC102BQ68D86 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC102BQ68D86 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC102BQ68D86 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC102BQ68D86 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC102BQ68D86 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC102BQ68D86 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC102BQ68D86 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
CCDC102BQ68D86 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC102BQ68D86 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC102BQ68D86 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC102BQ68D86 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC102BQ68D86 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC102BQ68D86 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC102BQ68D86 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC102BQ68D86 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC102BQ68D86 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC102BQ68D86 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC102BQ68D86 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC102BQ68D86 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC102BQ68D86 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC102BQ68D86 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC102BQ68D86 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC102BQ68D86 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC102BQ68D86 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC102BQ68D86 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC102BQ68D86 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC102BQ68D86 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC102BQ68D86 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC102BQ68D86 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC102BQ68D86 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC102BQ68D86 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC102BQ68D86 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC102BQ68D86 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC102BQ68D86 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC102BQ68D86 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC102BQ68D86 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC102BQ68D86 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC102BQ68D86 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC102BQ68D86 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC102BQ68D86 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC102BQ68D86 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC102BQ68D86 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC102BQ68D86 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC102BQ68D86 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC102BQ68D86 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC102BQ68D86 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC102BQ68D86 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC102BQ68D86 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC102BQ68D86 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC102BQ68D86 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC102BQ68D86 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC102BQ68D86 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC102BQ68D86 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC102BQ68D86 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC102BQ68D86 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC102BQ68D86 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC102BQ68D86 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC102BQ68D86 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC102BQ68D86 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC102BQ68D86 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC102BQ68D86 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC102BQ68D86 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC102BQ68D86 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC102BQ68D86 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC102BQ68D86 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC102BQ68D86 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC102BQ68D86 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC102BQ68D86 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC102BQ68D86 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC102BQ68D86 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC102BQ68D86 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC102BQ68D86 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC102BQ68D86 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC102BQ68D86 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC102BQ68D86 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC102BQ68D86 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC102BQ68D86 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC102BQ68D86 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC102BQ68D86 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC102BQ68D86 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC102BQ68D86 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC102BQ68D86 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
CCDC102BQ68D86 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC102BQ68D86 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC102BQ68D86 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC102BQ68D86 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC102BQ68D86 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC102BQ68D86 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC102BQ68D86 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC102BQ68D86 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC102BQ68D86 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC102BQ68D86 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC102BQ68D86 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC102BQ68D86 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC102BQ68D86 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC102BQ68D86 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC102BQ68D86 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC102BQ68D86 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms