Protein–RNA interactions for Protein: Q68CJ9

CREB3L3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3L3Q68CJ9 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CREB3L3Q68CJ9 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CREB3L3Q68CJ9 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CREB3L3Q68CJ9 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CREB3L3Q68CJ9 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CREB3L3Q68CJ9 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CREB3L3Q68CJ9 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CREB3L3Q68CJ9 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CREB3L3Q68CJ9 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CREB3L3Q68CJ9 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CREB3L3Q68CJ9 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CREB3L3Q68CJ9 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CREB3L3Q68CJ9 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CREB3L3Q68CJ9 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CREB3L3Q68CJ9 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CREB3L3Q68CJ9 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CREB3L3Q68CJ9 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CREB3L3Q68CJ9 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CREB3L3Q68CJ9 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CREB3L3Q68CJ9 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CREB3L3Q68CJ9 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CREB3L3Q68CJ9 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CREB3L3Q68CJ9 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CREB3L3Q68CJ9 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CREB3L3Q68CJ9 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CREB3L3Q68CJ9 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CREB3L3Q68CJ9 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CREB3L3Q68CJ9 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CREB3L3Q68CJ9 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CREB3L3Q68CJ9 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CREB3L3Q68CJ9 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CREB3L3Q68CJ9 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CREB3L3Q68CJ9 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CREB3L3Q68CJ9 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CREB3L3Q68CJ9 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CREB3L3Q68CJ9 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CREB3L3Q68CJ9 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CREB3L3Q68CJ9 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CREB3L3Q68CJ9 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CREB3L3Q68CJ9 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CREB3L3Q68CJ9 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CREB3L3Q68CJ9 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CREB3L3Q68CJ9 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CREB3L3Q68CJ9 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CREB3L3Q68CJ9 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CREB3L3Q68CJ9 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CREB3L3Q68CJ9 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CREB3L3Q68CJ9 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CREB3L3Q68CJ9 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CREB3L3Q68CJ9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CREB3L3Q68CJ9 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CREB3L3Q68CJ9 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CREB3L3Q68CJ9 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CREB3L3Q68CJ9 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CREB3L3Q68CJ9 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CREB3L3Q68CJ9 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CREB3L3Q68CJ9 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CREB3L3Q68CJ9 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CREB3L3Q68CJ9 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CREB3L3Q68CJ9 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CREB3L3Q68CJ9 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CREB3L3Q68CJ9 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CREB3L3Q68CJ9 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CREB3L3Q68CJ9 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CREB3L3Q68CJ9 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CREB3L3Q68CJ9 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CREB3L3Q68CJ9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CREB3L3Q68CJ9 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CREB3L3Q68CJ9 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CREB3L3Q68CJ9 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CREB3L3Q68CJ9 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CREB3L3Q68CJ9 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CREB3L3Q68CJ9 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CREB3L3Q68CJ9 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CREB3L3Q68CJ9 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CREB3L3Q68CJ9 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CREB3L3Q68CJ9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CREB3L3Q68CJ9 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CREB3L3Q68CJ9 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CREB3L3Q68CJ9 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CREB3L3Q68CJ9 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CREB3L3Q68CJ9 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CREB3L3Q68CJ9 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CREB3L3Q68CJ9 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CREB3L3Q68CJ9 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CREB3L3Q68CJ9 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CREB3L3Q68CJ9 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CREB3L3Q68CJ9 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CREB3L3Q68CJ9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CREB3L3Q68CJ9 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CREB3L3Q68CJ9 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CREB3L3Q68CJ9 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CREB3L3Q68CJ9 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CREB3L3Q68CJ9 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CREB3L3Q68CJ9 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CREB3L3Q68CJ9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CREB3L3Q68CJ9 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CREB3L3Q68CJ9 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CREB3L3Q68CJ9 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CREB3L3Q68CJ9 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms