Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUJ6

LRCH2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRCH2Q5VUJ6 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRCH2Q5VUJ6 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRCH2Q5VUJ6 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRCH2Q5VUJ6 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRCH2Q5VUJ6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRCH2Q5VUJ6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRCH2Q5VUJ6 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRCH2Q5VUJ6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRCH2Q5VUJ6 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRCH2Q5VUJ6 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRCH2Q5VUJ6 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRCH2Q5VUJ6 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
LRCH2Q5VUJ6 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRCH2Q5VUJ6 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRCH2Q5VUJ6 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
LRCH2Q5VUJ6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRCH2Q5VUJ6 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRCH2Q5VUJ6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRCH2Q5VUJ6 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRCH2Q5VUJ6 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRCH2Q5VUJ6 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
LRCH2Q5VUJ6 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRCH2Q5VUJ6 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRCH2Q5VUJ6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRCH2Q5VUJ6 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRCH2Q5VUJ6 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRCH2Q5VUJ6 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRCH2Q5VUJ6 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRCH2Q5VUJ6 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRCH2Q5VUJ6 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRCH2Q5VUJ6 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRCH2Q5VUJ6 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRCH2Q5VUJ6 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRCH2Q5VUJ6 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRCH2Q5VUJ6 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRCH2Q5VUJ6 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRCH2Q5VUJ6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRCH2Q5VUJ6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRCH2Q5VUJ6 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRCH2Q5VUJ6 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRCH2Q5VUJ6 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRCH2Q5VUJ6 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRCH2Q5VUJ6 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
LRCH2Q5VUJ6 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRCH2Q5VUJ6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRCH2Q5VUJ6 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRCH2Q5VUJ6 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRCH2Q5VUJ6 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRCH2Q5VUJ6 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRCH2Q5VUJ6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRCH2Q5VUJ6 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRCH2Q5VUJ6 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRCH2Q5VUJ6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRCH2Q5VUJ6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRCH2Q5VUJ6 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRCH2Q5VUJ6 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRCH2Q5VUJ6 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRCH2Q5VUJ6 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRCH2Q5VUJ6 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRCH2Q5VUJ6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRCH2Q5VUJ6 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRCH2Q5VUJ6 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRCH2Q5VUJ6 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRCH2Q5VUJ6 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRCH2Q5VUJ6 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRCH2Q5VUJ6 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRCH2Q5VUJ6 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRCH2Q5VUJ6 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRCH2Q5VUJ6 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRCH2Q5VUJ6 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRCH2Q5VUJ6 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRCH2Q5VUJ6 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRCH2Q5VUJ6 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRCH2Q5VUJ6 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
LRCH2Q5VUJ6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRCH2Q5VUJ6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRCH2Q5VUJ6 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRCH2Q5VUJ6 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRCH2Q5VUJ6 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRCH2Q5VUJ6 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRCH2Q5VUJ6 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRCH2Q5VUJ6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRCH2Q5VUJ6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRCH2Q5VUJ6 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRCH2Q5VUJ6 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRCH2Q5VUJ6 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRCH2Q5VUJ6 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRCH2Q5VUJ6 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRCH2Q5VUJ6 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRCH2Q5VUJ6 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRCH2Q5VUJ6 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRCH2Q5VUJ6 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRCH2Q5VUJ6 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRCH2Q5VUJ6 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRCH2Q5VUJ6 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRCH2Q5VUJ6 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
LRCH2Q5VUJ6 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRCH2Q5VUJ6 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRCH2Q5VUJ6 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRCH2Q5VUJ6 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms