Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUE5

C1orf53, Uncharacterized protein C1orf53, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf53Q5VUE5 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C1orf53Q5VUE5 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
C1orf53Q5VUE5 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
C1orf53Q5VUE5 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
C1orf53Q5VUE5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
C1orf53Q5VUE5 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
C1orf53Q5VUE5 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
C1orf53Q5VUE5 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
C1orf53Q5VUE5 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C1orf53Q5VUE5 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
C1orf53Q5VUE5 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C1orf53Q5VUE5 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C1orf53Q5VUE5 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C1orf53Q5VUE5 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
C1orf53Q5VUE5 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
C1orf53Q5VUE5 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
C1orf53Q5VUE5 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
C1orf53Q5VUE5 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C1orf53Q5VUE5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C1orf53Q5VUE5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C1orf53Q5VUE5 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C1orf53Q5VUE5 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C1orf53Q5VUE5 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C1orf53Q5VUE5 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
C1orf53Q5VUE5 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
C1orf53Q5VUE5 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
C1orf53Q5VUE5 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
C1orf53Q5VUE5 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
C1orf53Q5VUE5 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
C1orf53Q5VUE5 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C1orf53Q5VUE5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
C1orf53Q5VUE5 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
C1orf53Q5VUE5 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
C1orf53Q5VUE5 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
C1orf53Q5VUE5 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
C1orf53Q5VUE5 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C1orf53Q5VUE5 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C1orf53Q5VUE5 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C1orf53Q5VUE5 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
C1orf53Q5VUE5 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C1orf53Q5VUE5 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C1orf53Q5VUE5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C1orf53Q5VUE5 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C1orf53Q5VUE5 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
C1orf53Q5VUE5 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C1orf53Q5VUE5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
C1orf53Q5VUE5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C1orf53Q5VUE5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C1orf53Q5VUE5 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
C1orf53Q5VUE5 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C1orf53Q5VUE5 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C1orf53Q5VUE5 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
C1orf53Q5VUE5 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
C1orf53Q5VUE5 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
C1orf53Q5VUE5 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
C1orf53Q5VUE5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C1orf53Q5VUE5 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
C1orf53Q5VUE5 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
C1orf53Q5VUE5 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C1orf53Q5VUE5 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
C1orf53Q5VUE5 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
C1orf53Q5VUE5 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
C1orf53Q5VUE5 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
C1orf53Q5VUE5 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
C1orf53Q5VUE5 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
C1orf53Q5VUE5 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
C1orf53Q5VUE5 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
C1orf53Q5VUE5 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
C1orf53Q5VUE5 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C1orf53Q5VUE5 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C1orf53Q5VUE5 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
C1orf53Q5VUE5 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
C1orf53Q5VUE5 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
C1orf53Q5VUE5 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
C1orf53Q5VUE5 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
C1orf53Q5VUE5 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
C1orf53Q5VUE5 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
C1orf53Q5VUE5 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C1orf53Q5VUE5 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C1orf53Q5VUE5 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C1orf53Q5VUE5 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C1orf53Q5VUE5 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C1orf53Q5VUE5 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C1orf53Q5VUE5 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C1orf53Q5VUE5 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
C1orf53Q5VUE5 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C1orf53Q5VUE5 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C1orf53Q5VUE5 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C1orf53Q5VUE5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C1orf53Q5VUE5 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C1orf53Q5VUE5 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C1orf53Q5VUE5 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C1orf53Q5VUE5 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
C1orf53Q5VUE5 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C1orf53Q5VUE5 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
C1orf53Q5VUE5 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
C1orf53Q5VUE5 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
C1orf53Q5VUE5 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C1orf53Q5VUE5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C1orf53Q5VUE5 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms