Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTR2

RNF20, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1A, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF20Q5VTR2 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RNF20Q5VTR2 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RNF20Q5VTR2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RNF20Q5VTR2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RNF20Q5VTR2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RNF20Q5VTR2 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
RNF20Q5VTR2 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RNF20Q5VTR2 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RNF20Q5VTR2 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
RNF20Q5VTR2 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RNF20Q5VTR2 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RNF20Q5VTR2 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RNF20Q5VTR2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RNF20Q5VTR2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RNF20Q5VTR2 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RNF20Q5VTR2 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RNF20Q5VTR2 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RNF20Q5VTR2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RNF20Q5VTR2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RNF20Q5VTR2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RNF20Q5VTR2 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RNF20Q5VTR2 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RNF20Q5VTR2 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RNF20Q5VTR2 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RNF20Q5VTR2 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RNF20Q5VTR2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RNF20Q5VTR2 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RNF20Q5VTR2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RNF20Q5VTR2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RNF20Q5VTR2 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RNF20Q5VTR2 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RNF20Q5VTR2 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RNF20Q5VTR2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RNF20Q5VTR2 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RNF20Q5VTR2 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RNF20Q5VTR2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RNF20Q5VTR2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RNF20Q5VTR2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RNF20Q5VTR2 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RNF20Q5VTR2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
RNF20Q5VTR2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
RNF20Q5VTR2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RNF20Q5VTR2 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RNF20Q5VTR2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RNF20Q5VTR2 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RNF20Q5VTR2 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RNF20Q5VTR2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RNF20Q5VTR2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RNF20Q5VTR2 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RNF20Q5VTR2 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RNF20Q5VTR2 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RNF20Q5VTR2 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RNF20Q5VTR2 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RNF20Q5VTR2 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RNF20Q5VTR2 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RNF20Q5VTR2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
RNF20Q5VTR2 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
RNF20Q5VTR2 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RNF20Q5VTR2 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RNF20Q5VTR2 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RNF20Q5VTR2 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RNF20Q5VTR2 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RNF20Q5VTR2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RNF20Q5VTR2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RNF20Q5VTR2 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RNF20Q5VTR2 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RNF20Q5VTR2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RNF20Q5VTR2 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RNF20Q5VTR2 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RNF20Q5VTR2 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RNF20Q5VTR2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RNF20Q5VTR2 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RNF20Q5VTR2 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RNF20Q5VTR2 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
RNF20Q5VTR2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RNF20Q5VTR2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
RNF20Q5VTR2 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RNF20Q5VTR2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RNF20Q5VTR2 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RNF20Q5VTR2 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RNF20Q5VTR2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RNF20Q5VTR2 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RNF20Q5VTR2 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RNF20Q5VTR2 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RNF20Q5VTR2 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RNF20Q5VTR2 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
RNF20Q5VTR2 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RNF20Q5VTR2 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RNF20Q5VTR2 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RNF20Q5VTR2 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RNF20Q5VTR2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RNF20Q5VTR2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RNF20Q5VTR2 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RNF20Q5VTR2 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RNF20Q5VTR2 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RNF20Q5VTR2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RNF20Q5VTR2 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RNF20Q5VTR2 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RNF20Q5VTR2 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RNF20Q5VTR2 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms