Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGJ6

HDGFL1, Hepatoma-derived growth factor-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL1Q5TGJ6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
HDGFL1Q5TGJ6 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
HDGFL1Q5TGJ6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HDGFL1Q5TGJ6 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HDGFL1Q5TGJ6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HDGFL1Q5TGJ6 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HDGFL1Q5TGJ6 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HDGFL1Q5TGJ6 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HDGFL1Q5TGJ6 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
HDGFL1Q5TGJ6 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
HDGFL1Q5TGJ6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HDGFL1Q5TGJ6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HDGFL1Q5TGJ6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HDGFL1Q5TGJ6 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HDGFL1Q5TGJ6 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
HDGFL1Q5TGJ6 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HDGFL1Q5TGJ6 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
HDGFL1Q5TGJ6 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
HDGFL1Q5TGJ6 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
HDGFL1Q5TGJ6 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
HDGFL1Q5TGJ6 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
HDGFL1Q5TGJ6 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
HDGFL1Q5TGJ6 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HDGFL1Q5TGJ6 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
HDGFL1Q5TGJ6 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HDGFL1Q5TGJ6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
HDGFL1Q5TGJ6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
HDGFL1Q5TGJ6 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HDGFL1Q5TGJ6 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
HDGFL1Q5TGJ6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
HDGFL1Q5TGJ6 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
HDGFL1Q5TGJ6 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC28.17■■■□□ 2.1
HDGFL1Q5TGJ6 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC28.17■■■□□ 2.1
HDGFL1Q5TGJ6 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
HDGFL1Q5TGJ6 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
HDGFL1Q5TGJ6 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
HDGFL1Q5TGJ6 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
HDGFL1Q5TGJ6 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
HDGFL1Q5TGJ6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HDGFL1Q5TGJ6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HDGFL1Q5TGJ6 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HDGFL1Q5TGJ6 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HDGFL1Q5TGJ6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HDGFL1Q5TGJ6 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HDGFL1Q5TGJ6 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HDGFL1Q5TGJ6 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
HDGFL1Q5TGJ6 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HDGFL1Q5TGJ6 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HDGFL1Q5TGJ6 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HDGFL1Q5TGJ6 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HDGFL1Q5TGJ6 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HDGFL1Q5TGJ6 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HDGFL1Q5TGJ6 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HDGFL1Q5TGJ6 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HDGFL1Q5TGJ6 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HDGFL1Q5TGJ6 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HDGFL1Q5TGJ6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HDGFL1Q5TGJ6 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HDGFL1Q5TGJ6 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HDGFL1Q5TGJ6 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
HDGFL1Q5TGJ6 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
HDGFL1Q5TGJ6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
HDGFL1Q5TGJ6 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
HDGFL1Q5TGJ6 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.1
HDGFL1Q5TGJ6 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
HDGFL1Q5TGJ6 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
HDGFL1Q5TGJ6 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
HDGFL1Q5TGJ6 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
HDGFL1Q5TGJ6 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HDGFL1Q5TGJ6 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HDGFL1Q5TGJ6 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HDGFL1Q5TGJ6 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HDGFL1Q5TGJ6 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HDGFL1Q5TGJ6 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HDGFL1Q5TGJ6 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
HDGFL1Q5TGJ6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HDGFL1Q5TGJ6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HDGFL1Q5TGJ6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HDGFL1Q5TGJ6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HDGFL1Q5TGJ6 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HDGFL1Q5TGJ6 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
HDGFL1Q5TGJ6 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
HDGFL1Q5TGJ6 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HDGFL1Q5TGJ6 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HDGFL1Q5TGJ6 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
HDGFL1Q5TGJ6 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
HDGFL1Q5TGJ6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
HDGFL1Q5TGJ6 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
HDGFL1Q5TGJ6 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HDGFL1Q5TGJ6 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HDGFL1Q5TGJ6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HDGFL1Q5TGJ6 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HDGFL1Q5TGJ6 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HDGFL1Q5TGJ6 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HDGFL1Q5TGJ6 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HDGFL1Q5TGJ6 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HDGFL1Q5TGJ6 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
HDGFL1Q5TGJ6 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HDGFL1Q5TGJ6 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HDGFL1Q5TGJ6 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms