Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7P6

TMEM78, Transmembrane protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM78Q5T7P6 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM78Q5T7P6 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM78Q5T7P6 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM78Q5T7P6 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM78Q5T7P6 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM78Q5T7P6 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM78Q5T7P6 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM78Q5T7P6 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM78Q5T7P6 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM78Q5T7P6 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM78Q5T7P6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM78Q5T7P6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM78Q5T7P6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM78Q5T7P6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM78Q5T7P6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM78Q5T7P6 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM78Q5T7P6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM78Q5T7P6 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM78Q5T7P6 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM78Q5T7P6 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM78Q5T7P6 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM78Q5T7P6 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMEM78Q5T7P6 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMEM78Q5T7P6 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMEM78Q5T7P6 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMEM78Q5T7P6 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMEM78Q5T7P6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM78Q5T7P6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM78Q5T7P6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM78Q5T7P6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM78Q5T7P6 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM78Q5T7P6 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM78Q5T7P6 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM78Q5T7P6 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM78Q5T7P6 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM78Q5T7P6 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM78Q5T7P6 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM78Q5T7P6 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM78Q5T7P6 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM78Q5T7P6 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM78Q5T7P6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM78Q5T7P6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM78Q5T7P6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM78Q5T7P6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM78Q5T7P6 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM78Q5T7P6 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM78Q5T7P6 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM78Q5T7P6 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM78Q5T7P6 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM78Q5T7P6 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM78Q5T7P6 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM78Q5T7P6 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM78Q5T7P6 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM78Q5T7P6 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM78Q5T7P6 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM78Q5T7P6 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM78Q5T7P6 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM78Q5T7P6 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM78Q5T7P6 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM78Q5T7P6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM78Q5T7P6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM78Q5T7P6 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM78Q5T7P6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM78Q5T7P6 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM78Q5T7P6 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM78Q5T7P6 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM78Q5T7P6 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM78Q5T7P6 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM78Q5T7P6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM78Q5T7P6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM78Q5T7P6 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM78Q5T7P6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM78Q5T7P6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM78Q5T7P6 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM78Q5T7P6 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM78Q5T7P6 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM78Q5T7P6 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM78Q5T7P6 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM78Q5T7P6 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM78Q5T7P6 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM78Q5T7P6 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM78Q5T7P6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM78Q5T7P6 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM78Q5T7P6 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM78Q5T7P6 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM78Q5T7P6 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM78Q5T7P6 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM78Q5T7P6 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM78Q5T7P6 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM78Q5T7P6 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM78Q5T7P6 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM78Q5T7P6 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM78Q5T7P6 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM78Q5T7P6 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM78Q5T7P6 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM78Q5T7P6 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM78Q5T7P6 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM78Q5T7P6 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM78Q5T7P6 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM78Q5T7P6 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms