Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5X7

BEND3, BEN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEND3Q5T5X7 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
BEND3Q5T5X7 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
BEND3Q5T5X7 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
BEND3Q5T5X7 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
BEND3Q5T5X7 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
BEND3Q5T5X7 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
BEND3Q5T5X7 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
BEND3Q5T5X7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
BEND3Q5T5X7 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
BEND3Q5T5X7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
BEND3Q5T5X7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
BEND3Q5T5X7 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
BEND3Q5T5X7 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
BEND3Q5T5X7 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
BEND3Q5T5X7 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
BEND3Q5T5X7 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
BEND3Q5T5X7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
BEND3Q5T5X7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
BEND3Q5T5X7 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
BEND3Q5T5X7 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
BEND3Q5T5X7 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
BEND3Q5T5X7 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
BEND3Q5T5X7 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
BEND3Q5T5X7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
BEND3Q5T5X7 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
BEND3Q5T5X7 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
BEND3Q5T5X7 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
BEND3Q5T5X7 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
BEND3Q5T5X7 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
BEND3Q5T5X7 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
BEND3Q5T5X7 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
BEND3Q5T5X7 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
BEND3Q5T5X7 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
BEND3Q5T5X7 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
BEND3Q5T5X7 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
BEND3Q5T5X7 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
BEND3Q5T5X7 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
BEND3Q5T5X7 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
BEND3Q5T5X7 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
BEND3Q5T5X7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
BEND3Q5T5X7 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
BEND3Q5T5X7 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
BEND3Q5T5X7 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
BEND3Q5T5X7 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
BEND3Q5T5X7 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
BEND3Q5T5X7 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
BEND3Q5T5X7 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
BEND3Q5T5X7 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
BEND3Q5T5X7 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
BEND3Q5T5X7 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
BEND3Q5T5X7 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
BEND3Q5T5X7 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
BEND3Q5T5X7 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
BEND3Q5T5X7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
BEND3Q5T5X7 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
BEND3Q5T5X7 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
BEND3Q5T5X7 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
BEND3Q5T5X7 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
BEND3Q5T5X7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
BEND3Q5T5X7 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
BEND3Q5T5X7 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
BEND3Q5T5X7 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
BEND3Q5T5X7 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
BEND3Q5T5X7 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
BEND3Q5T5X7 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
BEND3Q5T5X7 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
BEND3Q5T5X7 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
BEND3Q5T5X7 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
BEND3Q5T5X7 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
BEND3Q5T5X7 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
BEND3Q5T5X7 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
BEND3Q5T5X7 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
BEND3Q5T5X7 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
BEND3Q5T5X7 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
BEND3Q5T5X7 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
BEND3Q5T5X7 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
BEND3Q5T5X7 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
BEND3Q5T5X7 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
BEND3Q5T5X7 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
BEND3Q5T5X7 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
BEND3Q5T5X7 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
BEND3Q5T5X7 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
BEND3Q5T5X7 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
BEND3Q5T5X7 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
BEND3Q5T5X7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
BEND3Q5T5X7 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
BEND3Q5T5X7 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
BEND3Q5T5X7 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
BEND3Q5T5X7 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
BEND3Q5T5X7 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
BEND3Q5T5X7 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
BEND3Q5T5X7 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
BEND3Q5T5X7 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
BEND3Q5T5X7 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
BEND3Q5T5X7 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
BEND3Q5T5X7 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
BEND3Q5T5X7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
BEND3Q5T5X7 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
BEND3Q5T5X7 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
BEND3Q5T5X7 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms