Protein–RNA interactions for Protein: Q5QGT7

RTP2, Receptor-transporting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP2Q5QGT7 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTP2Q5QGT7 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTP2Q5QGT7 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTP2Q5QGT7 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTP2Q5QGT7 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTP2Q5QGT7 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTP2Q5QGT7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTP2Q5QGT7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTP2Q5QGT7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTP2Q5QGT7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTP2Q5QGT7 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RTP2Q5QGT7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RTP2Q5QGT7 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RTP2Q5QGT7 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RTP2Q5QGT7 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RTP2Q5QGT7 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RTP2Q5QGT7 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RTP2Q5QGT7 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RTP2Q5QGT7 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RTP2Q5QGT7 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RTP2Q5QGT7 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RTP2Q5QGT7 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RTP2Q5QGT7 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RTP2Q5QGT7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RTP2Q5QGT7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RTP2Q5QGT7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RTP2Q5QGT7 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RTP2Q5QGT7 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RTP2Q5QGT7 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RTP2Q5QGT7 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RTP2Q5QGT7 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RTP2Q5QGT7 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RTP2Q5QGT7 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RTP2Q5QGT7 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RTP2Q5QGT7 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RTP2Q5QGT7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RTP2Q5QGT7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RTP2Q5QGT7 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RTP2Q5QGT7 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RTP2Q5QGT7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RTP2Q5QGT7 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RTP2Q5QGT7 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RTP2Q5QGT7 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RTP2Q5QGT7 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RTP2Q5QGT7 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RTP2Q5QGT7 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RTP2Q5QGT7 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RTP2Q5QGT7 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RTP2Q5QGT7 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RTP2Q5QGT7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RTP2Q5QGT7 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RTP2Q5QGT7 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RTP2Q5QGT7 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RTP2Q5QGT7 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RTP2Q5QGT7 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RTP2Q5QGT7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RTP2Q5QGT7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RTP2Q5QGT7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RTP2Q5QGT7 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RTP2Q5QGT7 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RTP2Q5QGT7 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RTP2Q5QGT7 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RTP2Q5QGT7 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RTP2Q5QGT7 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RTP2Q5QGT7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RTP2Q5QGT7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RTP2Q5QGT7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RTP2Q5QGT7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RTP2Q5QGT7 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RTP2Q5QGT7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RTP2Q5QGT7 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RTP2Q5QGT7 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RTP2Q5QGT7 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RTP2Q5QGT7 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RTP2Q5QGT7 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RTP2Q5QGT7 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RTP2Q5QGT7 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RTP2Q5QGT7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RTP2Q5QGT7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RTP2Q5QGT7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RTP2Q5QGT7 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RTP2Q5QGT7 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RTP2Q5QGT7 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RTP2Q5QGT7 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RTP2Q5QGT7 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RTP2Q5QGT7 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RTP2Q5QGT7 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RTP2Q5QGT7 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RTP2Q5QGT7 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RTP2Q5QGT7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RTP2Q5QGT7 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RTP2Q5QGT7 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RTP2Q5QGT7 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RTP2Q5QGT7 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RTP2Q5QGT7 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RTP2Q5QGT7 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RTP2Q5QGT7 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RTP2Q5QGT7 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RTP2Q5QGT7 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RTP2Q5QGT7 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms