Protein–RNA interactions for Protein: Q5J8X5

MS4A13, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 13, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A13Q5J8X5 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MS4A13Q5J8X5 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
MS4A13Q5J8X5 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MS4A13Q5J8X5 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MS4A13Q5J8X5 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MS4A13Q5J8X5 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MS4A13Q5J8X5 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MS4A13Q5J8X5 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MS4A13Q5J8X5 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MS4A13Q5J8X5 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MS4A13Q5J8X5 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MS4A13Q5J8X5 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MS4A13Q5J8X5 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MS4A13Q5J8X5 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MS4A13Q5J8X5 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MS4A13Q5J8X5 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MS4A13Q5J8X5 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MS4A13Q5J8X5 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MS4A13Q5J8X5 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MS4A13Q5J8X5 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MS4A13Q5J8X5 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MS4A13Q5J8X5 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MS4A13Q5J8X5 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MS4A13Q5J8X5 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MS4A13Q5J8X5 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MS4A13Q5J8X5 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MS4A13Q5J8X5 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MS4A13Q5J8X5 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MS4A13Q5J8X5 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MS4A13Q5J8X5 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MS4A13Q5J8X5 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MS4A13Q5J8X5 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MS4A13Q5J8X5 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MS4A13Q5J8X5 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MS4A13Q5J8X5 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MS4A13Q5J8X5 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MS4A13Q5J8X5 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MS4A13Q5J8X5 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MS4A13Q5J8X5 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MS4A13Q5J8X5 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MS4A13Q5J8X5 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MS4A13Q5J8X5 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MS4A13Q5J8X5 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MS4A13Q5J8X5 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MS4A13Q5J8X5 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MS4A13Q5J8X5 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MS4A13Q5J8X5 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MS4A13Q5J8X5 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MS4A13Q5J8X5 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MS4A13Q5J8X5 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MS4A13Q5J8X5 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MS4A13Q5J8X5 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MS4A13Q5J8X5 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MS4A13Q5J8X5 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MS4A13Q5J8X5 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MS4A13Q5J8X5 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MS4A13Q5J8X5 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MS4A13Q5J8X5 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MS4A13Q5J8X5 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MS4A13Q5J8X5 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MS4A13Q5J8X5 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MS4A13Q5J8X5 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MS4A13Q5J8X5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MS4A13Q5J8X5 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MS4A13Q5J8X5 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MS4A13Q5J8X5 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MS4A13Q5J8X5 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MS4A13Q5J8X5 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MS4A13Q5J8X5 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MS4A13Q5J8X5 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MS4A13Q5J8X5 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MS4A13Q5J8X5 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MS4A13Q5J8X5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MS4A13Q5J8X5 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MS4A13Q5J8X5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MS4A13Q5J8X5 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
MS4A13Q5J8X5 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MS4A13Q5J8X5 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MS4A13Q5J8X5 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MS4A13Q5J8X5 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MS4A13Q5J8X5 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MS4A13Q5J8X5 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MS4A13Q5J8X5 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MS4A13Q5J8X5 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MS4A13Q5J8X5 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MS4A13Q5J8X5 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MS4A13Q5J8X5 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MS4A13Q5J8X5 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MS4A13Q5J8X5 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MS4A13Q5J8X5 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MS4A13Q5J8X5 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MS4A13Q5J8X5 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MS4A13Q5J8X5 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MS4A13Q5J8X5 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MS4A13Q5J8X5 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MS4A13Q5J8X5 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MS4A13Q5J8X5 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MS4A13Q5J8X5 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MS4A13Q5J8X5 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MS4A13Q5J8X5 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms