Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJE1

CCDC178, Coiled-coil domain-containing protein 178, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC178Q5BJE1 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC178Q5BJE1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC178Q5BJE1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC178Q5BJE1 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC178Q5BJE1 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC178Q5BJE1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC178Q5BJE1 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC178Q5BJE1 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC178Q5BJE1 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC178Q5BJE1 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC178Q5BJE1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC178Q5BJE1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC178Q5BJE1 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC178Q5BJE1 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC178Q5BJE1 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC178Q5BJE1 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC178Q5BJE1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC178Q5BJE1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC178Q5BJE1 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC178Q5BJE1 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC178Q5BJE1 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC178Q5BJE1 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC178Q5BJE1 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC178Q5BJE1 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC178Q5BJE1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC178Q5BJE1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC178Q5BJE1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC178Q5BJE1 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC178Q5BJE1 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC178Q5BJE1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC178Q5BJE1 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC178Q5BJE1 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC178Q5BJE1 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC178Q5BJE1 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC178Q5BJE1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC178Q5BJE1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCDC178Q5BJE1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCDC178Q5BJE1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCDC178Q5BJE1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCDC178Q5BJE1 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC178Q5BJE1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC178Q5BJE1 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC178Q5BJE1 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC178Q5BJE1 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC178Q5BJE1 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC178Q5BJE1 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC178Q5BJE1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC178Q5BJE1 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC178Q5BJE1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC178Q5BJE1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC178Q5BJE1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC178Q5BJE1 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC178Q5BJE1 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC178Q5BJE1 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC178Q5BJE1 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC178Q5BJE1 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC178Q5BJE1 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC178Q5BJE1 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC178Q5BJE1 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC178Q5BJE1 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC178Q5BJE1 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC178Q5BJE1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC178Q5BJE1 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC178Q5BJE1 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC178Q5BJE1 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC178Q5BJE1 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC178Q5BJE1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC178Q5BJE1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC178Q5BJE1 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC178Q5BJE1 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC178Q5BJE1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC178Q5BJE1 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC178Q5BJE1 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC178Q5BJE1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC178Q5BJE1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC178Q5BJE1 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC178Q5BJE1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC178Q5BJE1 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC178Q5BJE1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC178Q5BJE1 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC178Q5BJE1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC178Q5BJE1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC178Q5BJE1 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC178Q5BJE1 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC178Q5BJE1 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC178Q5BJE1 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC178Q5BJE1 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC178Q5BJE1 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC178Q5BJE1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC178Q5BJE1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC178Q5BJE1 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC178Q5BJE1 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC178Q5BJE1 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC178Q5BJE1 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC178Q5BJE1 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC178Q5BJE1 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC178Q5BJE1 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC178Q5BJE1 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC178Q5BJE1 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC178Q5BJE1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms