Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ALFQ53S48 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ALFQ53S48 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ALFQ53S48 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ALFQ53S48 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ALFQ53S48 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ALFQ53S48 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ALFQ53S48 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ALFQ53S48 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ALFQ53S48 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ALFQ53S48 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ALFQ53S48 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ALFQ53S48 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ALFQ53S48 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ALFQ53S48 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ALFQ53S48 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ALFQ53S48 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ALFQ53S48 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ALFQ53S48 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ALFQ53S48 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ALFQ53S48 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ALFQ53S48 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ALFQ53S48 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ALFQ53S48 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ALFQ53S48 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ALFQ53S48 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ALFQ53S48 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ALFQ53S48 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ALFQ53S48 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ALFQ53S48 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ALFQ53S48 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ALFQ53S48 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ALFQ53S48 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ALFQ53S48 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ALFQ53S48 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ALFQ53S48 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ALFQ53S48 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ALFQ53S48 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ALFQ53S48 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ALFQ53S48 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ALFQ53S48 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ALFQ53S48 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALFQ53S48 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALFQ53S48 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALFQ53S48 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALFQ53S48 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALFQ53S48 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALFQ53S48 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALFQ53S48 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALFQ53S48 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALFQ53S48 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ALFQ53S48 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALFQ53S48 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ALFQ53S48 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALFQ53S48 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALFQ53S48 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALFQ53S48 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ALFQ53S48 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ALFQ53S48 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ALFQ53S48 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ALFQ53S48 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ALFQ53S48 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ALFQ53S48 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ALFQ53S48 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ALFQ53S48 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ALFQ53S48 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ALFQ53S48 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ALFQ53S48 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ALFQ53S48 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ALFQ53S48 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ALFQ53S48 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ALFQ53S48 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ALFQ53S48 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ALFQ53S48 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ALFQ53S48 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ALFQ53S48 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ALFQ53S48 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ALFQ53S48 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ALFQ53S48 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ALFQ53S48 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ALFQ53S48 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ALFQ53S48 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ALFQ53S48 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ALFQ53S48 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ALFQ53S48 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ALFQ53S48 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ALFQ53S48 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ALFQ53S48 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ALFQ53S48 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ALFQ53S48 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ALFQ53S48 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ALFQ53S48 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ALFQ53S48 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ALFQ53S48 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ALFQ53S48 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ALFQ53S48 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ALFQ53S48 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ALFQ53S48 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ALFQ53S48 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ALFQ53S48 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms