Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ANKRD39Q53RE8 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ANKRD39Q53RE8 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ANKRD39Q53RE8 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ANKRD39Q53RE8 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ANKRD39Q53RE8 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ANKRD39Q53RE8 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ANKRD39Q53RE8 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ANKRD39Q53RE8 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ANKRD39Q53RE8 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ANKRD39Q53RE8 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ANKRD39Q53RE8 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ANKRD39Q53RE8 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ANKRD39Q53RE8 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ANKRD39Q53RE8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ANKRD39Q53RE8 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ANKRD39Q53RE8 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ANKRD39Q53RE8 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ANKRD39Q53RE8 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ANKRD39Q53RE8 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ANKRD39Q53RE8 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ANKRD39Q53RE8 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ANKRD39Q53RE8 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ANKRD39Q53RE8 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ANKRD39Q53RE8 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ANKRD39Q53RE8 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ANKRD39Q53RE8 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ANKRD39Q53RE8 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ANKRD39Q53RE8 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ANKRD39Q53RE8 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ANKRD39Q53RE8 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ANKRD39Q53RE8 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ANKRD39Q53RE8 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ANKRD39Q53RE8 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ANKRD39Q53RE8 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ANKRD39Q53RE8 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ANKRD39Q53RE8 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ANKRD39Q53RE8 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ANKRD39Q53RE8 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ANKRD39Q53RE8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ANKRD39Q53RE8 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ANKRD39Q53RE8 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ANKRD39Q53RE8 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ANKRD39Q53RE8 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ANKRD39Q53RE8 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ANKRD39Q53RE8 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ANKRD39Q53RE8 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ANKRD39Q53RE8 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ANKRD39Q53RE8 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ANKRD39Q53RE8 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ANKRD39Q53RE8 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ANKRD39Q53RE8 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ANKRD39Q53RE8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ANKRD39Q53RE8 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ANKRD39Q53RE8 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ANKRD39Q53RE8 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ANKRD39Q53RE8 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ANKRD39Q53RE8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ANKRD39Q53RE8 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ANKRD39Q53RE8 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ANKRD39Q53RE8 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ANKRD39Q53RE8 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ANKRD39Q53RE8 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ANKRD39Q53RE8 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ANKRD39Q53RE8 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ANKRD39Q53RE8 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ANKRD39Q53RE8 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ANKRD39Q53RE8 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ANKRD39Q53RE8 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ANKRD39Q53RE8 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ANKRD39Q53RE8 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ANKRD39Q53RE8 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ANKRD39Q53RE8 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ANKRD39Q53RE8 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ANKRD39Q53RE8 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ANKRD39Q53RE8 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ANKRD39Q53RE8 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ANKRD39Q53RE8 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ANKRD39Q53RE8 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ANKRD39Q53RE8 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ANKRD39Q53RE8 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ANKRD39Q53RE8 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ANKRD39Q53RE8 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ANKRD39Q53RE8 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ANKRD39Q53RE8 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ANKRD39Q53RE8 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ANKRD39Q53RE8 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ANKRD39Q53RE8 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ANKRD39Q53RE8 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ANKRD39Q53RE8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ANKRD39Q53RE8 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ANKRD39Q53RE8 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ANKRD39Q53RE8 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ANKRD39Q53RE8 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ANKRD39Q53RE8 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ANKRD39Q53RE8 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD39Q53RE8 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD39Q53RE8 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD39Q53RE8 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD39Q53RE8 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms