Protein–RNA interactions for Protein: Q4VNC1

ATP13A4, Probable cation-transporting ATPase 13A4, humanhuman

Predictions only

Length 1,196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP13A4Q4VNC1 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP13A4Q4VNC1 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP13A4Q4VNC1 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP13A4Q4VNC1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP13A4Q4VNC1 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP13A4Q4VNC1 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP13A4Q4VNC1 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP13A4Q4VNC1 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP13A4Q4VNC1 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP13A4Q4VNC1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP13A4Q4VNC1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP13A4Q4VNC1 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP13A4Q4VNC1 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP13A4Q4VNC1 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP13A4Q4VNC1 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP13A4Q4VNC1 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP13A4Q4VNC1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP13A4Q4VNC1 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP13A4Q4VNC1 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP13A4Q4VNC1 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP13A4Q4VNC1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP13A4Q4VNC1 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP13A4Q4VNC1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP13A4Q4VNC1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP13A4Q4VNC1 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP13A4Q4VNC1 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP13A4Q4VNC1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP13A4Q4VNC1 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP13A4Q4VNC1 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP13A4Q4VNC1 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP13A4Q4VNC1 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP13A4Q4VNC1 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP13A4Q4VNC1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP13A4Q4VNC1 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP13A4Q4VNC1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP13A4Q4VNC1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP13A4Q4VNC1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP13A4Q4VNC1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP13A4Q4VNC1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP13A4Q4VNC1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP13A4Q4VNC1 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP13A4Q4VNC1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP13A4Q4VNC1 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP13A4Q4VNC1 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP13A4Q4VNC1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP13A4Q4VNC1 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP13A4Q4VNC1 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP13A4Q4VNC1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP13A4Q4VNC1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP13A4Q4VNC1 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP13A4Q4VNC1 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP13A4Q4VNC1 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP13A4Q4VNC1 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP13A4Q4VNC1 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP13A4Q4VNC1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP13A4Q4VNC1 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP13A4Q4VNC1 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP13A4Q4VNC1 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP13A4Q4VNC1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP13A4Q4VNC1 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP13A4Q4VNC1 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP13A4Q4VNC1 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP13A4Q4VNC1 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP13A4Q4VNC1 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP13A4Q4VNC1 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP13A4Q4VNC1 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP13A4Q4VNC1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP13A4Q4VNC1 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP13A4Q4VNC1 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP13A4Q4VNC1 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP13A4Q4VNC1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP13A4Q4VNC1 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP13A4Q4VNC1 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP13A4Q4VNC1 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP13A4Q4VNC1 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP13A4Q4VNC1 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP13A4Q4VNC1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP13A4Q4VNC1 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP13A4Q4VNC1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP13A4Q4VNC1 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP13A4Q4VNC1 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP13A4Q4VNC1 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATP13A4Q4VNC1 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATP13A4Q4VNC1 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP13A4Q4VNC1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP13A4Q4VNC1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP13A4Q4VNC1 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP13A4Q4VNC1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP13A4Q4VNC1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP13A4Q4VNC1 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP13A4Q4VNC1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP13A4Q4VNC1 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP13A4Q4VNC1 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP13A4Q4VNC1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP13A4Q4VNC1 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP13A4Q4VNC1 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP13A4Q4VNC1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP13A4Q4VNC1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP13A4Q4VNC1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP13A4Q4VNC1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms