Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTXN3Q4LDR2 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTXN3Q4LDR2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTXN3Q4LDR2 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTXN3Q4LDR2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTXN3Q4LDR2 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTXN3Q4LDR2 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTXN3Q4LDR2 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTXN3Q4LDR2 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTXN3Q4LDR2 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTXN3Q4LDR2 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTXN3Q4LDR2 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTXN3Q4LDR2 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTXN3Q4LDR2 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CTXN3Q4LDR2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTXN3Q4LDR2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTXN3Q4LDR2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTXN3Q4LDR2 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTXN3Q4LDR2 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTXN3Q4LDR2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTXN3Q4LDR2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTXN3Q4LDR2 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTXN3Q4LDR2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTXN3Q4LDR2 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTXN3Q4LDR2 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTXN3Q4LDR2 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTXN3Q4LDR2 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTXN3Q4LDR2 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTXN3Q4LDR2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTXN3Q4LDR2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTXN3Q4LDR2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTXN3Q4LDR2 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTXN3Q4LDR2 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTXN3Q4LDR2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTXN3Q4LDR2 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTXN3Q4LDR2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTXN3Q4LDR2 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTXN3Q4LDR2 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CTXN3Q4LDR2 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CTXN3Q4LDR2 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTXN3Q4LDR2 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTXN3Q4LDR2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTXN3Q4LDR2 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTXN3Q4LDR2 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTXN3Q4LDR2 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CTXN3Q4LDR2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTXN3Q4LDR2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTXN3Q4LDR2 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CTXN3Q4LDR2 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CTXN3Q4LDR2 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CTXN3Q4LDR2 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CTXN3Q4LDR2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTXN3Q4LDR2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTXN3Q4LDR2 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTXN3Q4LDR2 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTXN3Q4LDR2 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTXN3Q4LDR2 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTXN3Q4LDR2 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTXN3Q4LDR2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTXN3Q4LDR2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTXN3Q4LDR2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTXN3Q4LDR2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CTXN3Q4LDR2 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTXN3Q4LDR2 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTXN3Q4LDR2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTXN3Q4LDR2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTXN3Q4LDR2 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTXN3Q4LDR2 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTXN3Q4LDR2 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTXN3Q4LDR2 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTXN3Q4LDR2 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTXN3Q4LDR2 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CTXN3Q4LDR2 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTXN3Q4LDR2 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTXN3Q4LDR2 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTXN3Q4LDR2 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTXN3Q4LDR2 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTXN3Q4LDR2 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTXN3Q4LDR2 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTXN3Q4LDR2 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTXN3Q4LDR2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTXN3Q4LDR2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTXN3Q4LDR2 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTXN3Q4LDR2 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTXN3Q4LDR2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTXN3Q4LDR2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTXN3Q4LDR2 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTXN3Q4LDR2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTXN3Q4LDR2 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTXN3Q4LDR2 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTXN3Q4LDR2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTXN3Q4LDR2 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTXN3Q4LDR2 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTXN3Q4LDR2 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTXN3Q4LDR2 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTXN3Q4LDR2 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTXN3Q4LDR2 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTXN3Q4LDR2 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTXN3Q4LDR2 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTXN3Q4LDR2 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms