Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDE5

SVEP1, Sushi, von Willebrand factor type A, EGF and pentraxin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 3,571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVEP1Q4LDE5 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SVEP1Q4LDE5 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SVEP1Q4LDE5 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SVEP1Q4LDE5 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SVEP1Q4LDE5 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SVEP1Q4LDE5 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SVEP1Q4LDE5 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SVEP1Q4LDE5 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SVEP1Q4LDE5 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SVEP1Q4LDE5 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SVEP1Q4LDE5 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SVEP1Q4LDE5 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SVEP1Q4LDE5 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SVEP1Q4LDE5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SVEP1Q4LDE5 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SVEP1Q4LDE5 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SVEP1Q4LDE5 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SVEP1Q4LDE5 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SVEP1Q4LDE5 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SVEP1Q4LDE5 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SVEP1Q4LDE5 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SVEP1Q4LDE5 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SVEP1Q4LDE5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SVEP1Q4LDE5 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SVEP1Q4LDE5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SVEP1Q4LDE5 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SVEP1Q4LDE5 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SVEP1Q4LDE5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SVEP1Q4LDE5 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SVEP1Q4LDE5 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SVEP1Q4LDE5 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SVEP1Q4LDE5 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SVEP1Q4LDE5 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SVEP1Q4LDE5 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SVEP1Q4LDE5 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SVEP1Q4LDE5 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SVEP1Q4LDE5 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SVEP1Q4LDE5 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SVEP1Q4LDE5 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SVEP1Q4LDE5 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SVEP1Q4LDE5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SVEP1Q4LDE5 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SVEP1Q4LDE5 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SVEP1Q4LDE5 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SVEP1Q4LDE5 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SVEP1Q4LDE5 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SVEP1Q4LDE5 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SVEP1Q4LDE5 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SVEP1Q4LDE5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SVEP1Q4LDE5 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SVEP1Q4LDE5 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SVEP1Q4LDE5 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SVEP1Q4LDE5 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SVEP1Q4LDE5 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SVEP1Q4LDE5 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SVEP1Q4LDE5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SVEP1Q4LDE5 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SVEP1Q4LDE5 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SVEP1Q4LDE5 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SVEP1Q4LDE5 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SVEP1Q4LDE5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SVEP1Q4LDE5 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SVEP1Q4LDE5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SVEP1Q4LDE5 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SVEP1Q4LDE5 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SVEP1Q4LDE5 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SVEP1Q4LDE5 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SVEP1Q4LDE5 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SVEP1Q4LDE5 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SVEP1Q4LDE5 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SVEP1Q4LDE5 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SVEP1Q4LDE5 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SVEP1Q4LDE5 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SVEP1Q4LDE5 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SVEP1Q4LDE5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SVEP1Q4LDE5 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SVEP1Q4LDE5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SVEP1Q4LDE5 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SVEP1Q4LDE5 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SVEP1Q4LDE5 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SVEP1Q4LDE5 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SVEP1Q4LDE5 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SVEP1Q4LDE5 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SVEP1Q4LDE5 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SVEP1Q4LDE5 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SVEP1Q4LDE5 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SVEP1Q4LDE5 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SVEP1Q4LDE5 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SVEP1Q4LDE5 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SVEP1Q4LDE5 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SVEP1Q4LDE5 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SVEP1Q4LDE5 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SVEP1Q4LDE5 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SVEP1Q4LDE5 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SVEP1Q4LDE5 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SVEP1Q4LDE5 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SVEP1Q4LDE5 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SVEP1Q4LDE5 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SVEP1Q4LDE5 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SVEP1Q4LDE5 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms