Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0U5

CFAP221, Cilia- and flagella-associated protein 221, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP221Q4G0U5 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CFAP221Q4G0U5 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CFAP221Q4G0U5 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CFAP221Q4G0U5 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CFAP221Q4G0U5 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CFAP221Q4G0U5 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CFAP221Q4G0U5 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CFAP221Q4G0U5 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CFAP221Q4G0U5 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CFAP221Q4G0U5 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CFAP221Q4G0U5 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CFAP221Q4G0U5 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CFAP221Q4G0U5 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CFAP221Q4G0U5 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CFAP221Q4G0U5 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CFAP221Q4G0U5 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CFAP221Q4G0U5 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CFAP221Q4G0U5 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CFAP221Q4G0U5 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CFAP221Q4G0U5 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CFAP221Q4G0U5 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CFAP221Q4G0U5 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CFAP221Q4G0U5 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CFAP221Q4G0U5 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CFAP221Q4G0U5 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CFAP221Q4G0U5 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CFAP221Q4G0U5 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CFAP221Q4G0U5 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CFAP221Q4G0U5 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CFAP221Q4G0U5 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CFAP221Q4G0U5 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CFAP221Q4G0U5 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CFAP221Q4G0U5 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CFAP221Q4G0U5 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CFAP221Q4G0U5 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CFAP221Q4G0U5 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CFAP221Q4G0U5 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CFAP221Q4G0U5 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CFAP221Q4G0U5 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CFAP221Q4G0U5 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CFAP221Q4G0U5 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CFAP221Q4G0U5 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CFAP221Q4G0U5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CFAP221Q4G0U5 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CFAP221Q4G0U5 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CFAP221Q4G0U5 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CFAP221Q4G0U5 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CFAP221Q4G0U5 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CFAP221Q4G0U5 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CFAP221Q4G0U5 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CFAP221Q4G0U5 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CFAP221Q4G0U5 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CFAP221Q4G0U5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CFAP221Q4G0U5 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CFAP221Q4G0U5 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CFAP221Q4G0U5 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CFAP221Q4G0U5 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CFAP221Q4G0U5 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CFAP221Q4G0U5 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CFAP221Q4G0U5 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CFAP221Q4G0U5 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CFAP221Q4G0U5 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CFAP221Q4G0U5 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CFAP221Q4G0U5 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CFAP221Q4G0U5 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CFAP221Q4G0U5 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CFAP221Q4G0U5 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CFAP221Q4G0U5 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CFAP221Q4G0U5 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CFAP221Q4G0U5 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CFAP221Q4G0U5 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CFAP221Q4G0U5 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CFAP221Q4G0U5 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CFAP221Q4G0U5 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CFAP221Q4G0U5 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CFAP221Q4G0U5 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CFAP221Q4G0U5 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CFAP221Q4G0U5 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CFAP221Q4G0U5 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CFAP221Q4G0U5 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CFAP221Q4G0U5 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CFAP221Q4G0U5 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CFAP221Q4G0U5 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CFAP221Q4G0U5 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CFAP221Q4G0U5 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CFAP221Q4G0U5 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CFAP221Q4G0U5 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CFAP221Q4G0U5 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CFAP221Q4G0U5 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CFAP221Q4G0U5 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CFAP221Q4G0U5 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CFAP221Q4G0U5 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CFAP221Q4G0U5 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CFAP221Q4G0U5 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CFAP221Q4G0U5 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CFAP221Q4G0U5 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CFAP221Q4G0U5 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CFAP221Q4G0U5 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CFAP221Q4G0U5 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CFAP221Q4G0U5 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms