Protein–RNA interactions for Protein: Q49AG3

ZBED5, Zinc finger BED domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED5Q49AG3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZBED5Q49AG3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZBED5Q49AG3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZBED5Q49AG3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZBED5Q49AG3 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZBED5Q49AG3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZBED5Q49AG3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZBED5Q49AG3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZBED5Q49AG3 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZBED5Q49AG3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZBED5Q49AG3 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZBED5Q49AG3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZBED5Q49AG3 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZBED5Q49AG3 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZBED5Q49AG3 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZBED5Q49AG3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZBED5Q49AG3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZBED5Q49AG3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZBED5Q49AG3 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZBED5Q49AG3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZBED5Q49AG3 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZBED5Q49AG3 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZBED5Q49AG3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZBED5Q49AG3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZBED5Q49AG3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZBED5Q49AG3 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZBED5Q49AG3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZBED5Q49AG3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZBED5Q49AG3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZBED5Q49AG3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZBED5Q49AG3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZBED5Q49AG3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZBED5Q49AG3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZBED5Q49AG3 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZBED5Q49AG3 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZBED5Q49AG3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZBED5Q49AG3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZBED5Q49AG3 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZBED5Q49AG3 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZBED5Q49AG3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZBED5Q49AG3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZBED5Q49AG3 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZBED5Q49AG3 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZBED5Q49AG3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZBED5Q49AG3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZBED5Q49AG3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZBED5Q49AG3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZBED5Q49AG3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZBED5Q49AG3 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZBED5Q49AG3 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZBED5Q49AG3 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZBED5Q49AG3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZBED5Q49AG3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZBED5Q49AG3 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZBED5Q49AG3 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZBED5Q49AG3 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZBED5Q49AG3 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZBED5Q49AG3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZBED5Q49AG3 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZBED5Q49AG3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZBED5Q49AG3 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZBED5Q49AG3 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZBED5Q49AG3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZBED5Q49AG3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZBED5Q49AG3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZBED5Q49AG3 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZBED5Q49AG3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZBED5Q49AG3 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZBED5Q49AG3 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZBED5Q49AG3 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZBED5Q49AG3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZBED5Q49AG3 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZBED5Q49AG3 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZBED5Q49AG3 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZBED5Q49AG3 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZBED5Q49AG3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZBED5Q49AG3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZBED5Q49AG3 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZBED5Q49AG3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZBED5Q49AG3 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZBED5Q49AG3 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZBED5Q49AG3 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZBED5Q49AG3 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZBED5Q49AG3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZBED5Q49AG3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ZBED5Q49AG3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZBED5Q49AG3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZBED5Q49AG3 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZBED5Q49AG3 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZBED5Q49AG3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZBED5Q49AG3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZBED5Q49AG3 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZBED5Q49AG3 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZBED5Q49AG3 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZBED5Q49AG3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZBED5Q49AG3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZBED5Q49AG3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZBED5Q49AG3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZBED5Q49AG3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZBED5Q49AG3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms