Protein–RNA interactions for Protein: Q3MIT2

PUS10, Putative tRNA pseudouridine synthase Pus10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS10Q3MIT2 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PUS10Q3MIT2 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PUS10Q3MIT2 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PUS10Q3MIT2 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PUS10Q3MIT2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PUS10Q3MIT2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PUS10Q3MIT2 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PUS10Q3MIT2 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PUS10Q3MIT2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PUS10Q3MIT2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PUS10Q3MIT2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PUS10Q3MIT2 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PUS10Q3MIT2 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PUS10Q3MIT2 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PUS10Q3MIT2 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PUS10Q3MIT2 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PUS10Q3MIT2 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PUS10Q3MIT2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PUS10Q3MIT2 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PUS10Q3MIT2 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PUS10Q3MIT2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PUS10Q3MIT2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PUS10Q3MIT2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PUS10Q3MIT2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PUS10Q3MIT2 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PUS10Q3MIT2 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PUS10Q3MIT2 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PUS10Q3MIT2 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PUS10Q3MIT2 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PUS10Q3MIT2 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PUS10Q3MIT2 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PUS10Q3MIT2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PUS10Q3MIT2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PUS10Q3MIT2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PUS10Q3MIT2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PUS10Q3MIT2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PUS10Q3MIT2 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PUS10Q3MIT2 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PUS10Q3MIT2 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PUS10Q3MIT2 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PUS10Q3MIT2 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PUS10Q3MIT2 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PUS10Q3MIT2 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PUS10Q3MIT2 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PUS10Q3MIT2 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PUS10Q3MIT2 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PUS10Q3MIT2 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PUS10Q3MIT2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PUS10Q3MIT2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PUS10Q3MIT2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PUS10Q3MIT2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PUS10Q3MIT2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PUS10Q3MIT2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
PUS10Q3MIT2 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PUS10Q3MIT2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PUS10Q3MIT2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PUS10Q3MIT2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PUS10Q3MIT2 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PUS10Q3MIT2 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PUS10Q3MIT2 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PUS10Q3MIT2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PUS10Q3MIT2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PUS10Q3MIT2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PUS10Q3MIT2 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PUS10Q3MIT2 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PUS10Q3MIT2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PUS10Q3MIT2 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PUS10Q3MIT2 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PUS10Q3MIT2 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PUS10Q3MIT2 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PUS10Q3MIT2 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PUS10Q3MIT2 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PUS10Q3MIT2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PUS10Q3MIT2 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PUS10Q3MIT2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PUS10Q3MIT2 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PUS10Q3MIT2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PUS10Q3MIT2 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PUS10Q3MIT2 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PUS10Q3MIT2 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PUS10Q3MIT2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PUS10Q3MIT2 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PUS10Q3MIT2 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PUS10Q3MIT2 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PUS10Q3MIT2 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PUS10Q3MIT2 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PUS10Q3MIT2 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PUS10Q3MIT2 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PUS10Q3MIT2 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PUS10Q3MIT2 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PUS10Q3MIT2 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PUS10Q3MIT2 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PUS10Q3MIT2 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PUS10Q3MIT2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PUS10Q3MIT2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PUS10Q3MIT2 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PUS10Q3MIT2 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PUS10Q3MIT2 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PUS10Q3MIT2 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PUS10Q3MIT2 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms