Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPB7

AP5B1, AP-5 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP5B1Q2VPB7 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AP5B1Q2VPB7 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AP5B1Q2VPB7 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
AP5B1Q2VPB7 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
AP5B1Q2VPB7 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AP5B1Q2VPB7 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
AP5B1Q2VPB7 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AP5B1Q2VPB7 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AP5B1Q2VPB7 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AP5B1Q2VPB7 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AP5B1Q2VPB7 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AP5B1Q2VPB7 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AP5B1Q2VPB7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AP5B1Q2VPB7 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AP5B1Q2VPB7 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AP5B1Q2VPB7 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
AP5B1Q2VPB7 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AP5B1Q2VPB7 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.28■■□□□ 1
AP5B1Q2VPB7 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AP5B1Q2VPB7 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
AP5B1Q2VPB7 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
AP5B1Q2VPB7 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AP5B1Q2VPB7 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
AP5B1Q2VPB7 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AP5B1Q2VPB7 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AP5B1Q2VPB7 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AP5B1Q2VPB7 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
AP5B1Q2VPB7 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AP5B1Q2VPB7 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
AP5B1Q2VPB7 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
AP5B1Q2VPB7 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
AP5B1Q2VPB7 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AP5B1Q2VPB7 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
AP5B1Q2VPB7 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AP5B1Q2VPB7 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AP5B1Q2VPB7 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AP5B1Q2VPB7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AP5B1Q2VPB7 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AP5B1Q2VPB7 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
AP5B1Q2VPB7 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
AP5B1Q2VPB7 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
AP5B1Q2VPB7 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
AP5B1Q2VPB7 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
AP5B1Q2VPB7 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
AP5B1Q2VPB7 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
AP5B1Q2VPB7 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AP5B1Q2VPB7 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AP5B1Q2VPB7 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AP5B1Q2VPB7 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AP5B1Q2VPB7 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AP5B1Q2VPB7 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
AP5B1Q2VPB7 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AP5B1Q2VPB7 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AP5B1Q2VPB7 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AP5B1Q2VPB7 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AP5B1Q2VPB7 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AP5B1Q2VPB7 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AP5B1Q2VPB7 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AP5B1Q2VPB7 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AP5B1Q2VPB7 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AP5B1Q2VPB7 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AP5B1Q2VPB7 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AP5B1Q2VPB7 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AP5B1Q2VPB7 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AP5B1Q2VPB7 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AP5B1Q2VPB7 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AP5B1Q2VPB7 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AP5B1Q2VPB7 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AP5B1Q2VPB7 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AP5B1Q2VPB7 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AP5B1Q2VPB7 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AP5B1Q2VPB7 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AP5B1Q2VPB7 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
AP5B1Q2VPB7 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AP5B1Q2VPB7 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
AP5B1Q2VPB7 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AP5B1Q2VPB7 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
AP5B1Q2VPB7 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AP5B1Q2VPB7 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
AP5B1Q2VPB7 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
AP5B1Q2VPB7 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AP5B1Q2VPB7 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
AP5B1Q2VPB7 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AP5B1Q2VPB7 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AP5B1Q2VPB7 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
AP5B1Q2VPB7 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
AP5B1Q2VPB7 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AP5B1Q2VPB7 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AP5B1Q2VPB7 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AP5B1Q2VPB7 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AP5B1Q2VPB7 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AP5B1Q2VPB7 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
AP5B1Q2VPB7 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
AP5B1Q2VPB7 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
AP5B1Q2VPB7 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
AP5B1Q2VPB7 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
AP5B1Q2VPB7 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
AP5B1Q2VPB7 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AP5B1Q2VPB7 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AP5B1Q2VPB7 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms