Protein–RNA interactions for Protein: Q2NL68

PROSER3, Proline and serine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROSER3Q2NL68 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PROSER3Q2NL68 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PROSER3Q2NL68 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
PROSER3Q2NL68 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PROSER3Q2NL68 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PROSER3Q2NL68 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PROSER3Q2NL68 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PROSER3Q2NL68 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PROSER3Q2NL68 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PROSER3Q2NL68 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PROSER3Q2NL68 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PROSER3Q2NL68 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PROSER3Q2NL68 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PROSER3Q2NL68 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PROSER3Q2NL68 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PROSER3Q2NL68 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PROSER3Q2NL68 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PROSER3Q2NL68 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PROSER3Q2NL68 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PROSER3Q2NL68 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PROSER3Q2NL68 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
PROSER3Q2NL68 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PROSER3Q2NL68 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PROSER3Q2NL68 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PROSER3Q2NL68 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PROSER3Q2NL68 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PROSER3Q2NL68 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PROSER3Q2NL68 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PROSER3Q2NL68 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PROSER3Q2NL68 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PROSER3Q2NL68 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PROSER3Q2NL68 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PROSER3Q2NL68 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PROSER3Q2NL68 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PROSER3Q2NL68 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PROSER3Q2NL68 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PROSER3Q2NL68 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PROSER3Q2NL68 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PROSER3Q2NL68 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PROSER3Q2NL68 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PROSER3Q2NL68 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PROSER3Q2NL68 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
PROSER3Q2NL68 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PROSER3Q2NL68 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PROSER3Q2NL68 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PROSER3Q2NL68 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PROSER3Q2NL68 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PROSER3Q2NL68 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PROSER3Q2NL68 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PROSER3Q2NL68 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
PROSER3Q2NL68 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
PROSER3Q2NL68 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PROSER3Q2NL68 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PROSER3Q2NL68 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PROSER3Q2NL68 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PROSER3Q2NL68 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PROSER3Q2NL68 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PROSER3Q2NL68 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PROSER3Q2NL68 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PROSER3Q2NL68 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
PROSER3Q2NL68 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PROSER3Q2NL68 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PROSER3Q2NL68 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PROSER3Q2NL68 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PROSER3Q2NL68 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PROSER3Q2NL68 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PROSER3Q2NL68 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PROSER3Q2NL68 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PROSER3Q2NL68 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
PROSER3Q2NL68 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PROSER3Q2NL68 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PROSER3Q2NL68 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PROSER3Q2NL68 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PROSER3Q2NL68 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PROSER3Q2NL68 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PROSER3Q2NL68 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PROSER3Q2NL68 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
PROSER3Q2NL68 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
PROSER3Q2NL68 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
PROSER3Q2NL68 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PROSER3Q2NL68 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PROSER3Q2NL68 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PROSER3Q2NL68 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
PROSER3Q2NL68 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PROSER3Q2NL68 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PROSER3Q2NL68 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PROSER3Q2NL68 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PROSER3Q2NL68 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PROSER3Q2NL68 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
PROSER3Q2NL68 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PROSER3Q2NL68 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PROSER3Q2NL68 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PROSER3Q2NL68 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
PROSER3Q2NL68 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PROSER3Q2NL68 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PROSER3Q2NL68 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PROSER3Q2NL68 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PROSER3Q2NL68 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PROSER3Q2NL68 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PROSER3Q2NL68 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms