Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKJ3

CTC1, CST complex subunit CTC1, humanhuman

Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTC1Q2NKJ3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTC1Q2NKJ3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CTC1Q2NKJ3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTC1Q2NKJ3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTC1Q2NKJ3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTC1Q2NKJ3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTC1Q2NKJ3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTC1Q2NKJ3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTC1Q2NKJ3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTC1Q2NKJ3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTC1Q2NKJ3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTC1Q2NKJ3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTC1Q2NKJ3 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTC1Q2NKJ3 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTC1Q2NKJ3 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTC1Q2NKJ3 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTC1Q2NKJ3 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTC1Q2NKJ3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTC1Q2NKJ3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTC1Q2NKJ3 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTC1Q2NKJ3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTC1Q2NKJ3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTC1Q2NKJ3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTC1Q2NKJ3 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTC1Q2NKJ3 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTC1Q2NKJ3 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTC1Q2NKJ3 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CTC1Q2NKJ3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CTC1Q2NKJ3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTC1Q2NKJ3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTC1Q2NKJ3 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTC1Q2NKJ3 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTC1Q2NKJ3 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CTC1Q2NKJ3 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTC1Q2NKJ3 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTC1Q2NKJ3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTC1Q2NKJ3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTC1Q2NKJ3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTC1Q2NKJ3 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTC1Q2NKJ3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTC1Q2NKJ3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTC1Q2NKJ3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTC1Q2NKJ3 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTC1Q2NKJ3 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTC1Q2NKJ3 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTC1Q2NKJ3 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTC1Q2NKJ3 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTC1Q2NKJ3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTC1Q2NKJ3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTC1Q2NKJ3 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTC1Q2NKJ3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTC1Q2NKJ3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTC1Q2NKJ3 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTC1Q2NKJ3 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CTC1Q2NKJ3 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTC1Q2NKJ3 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CTC1Q2NKJ3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTC1Q2NKJ3 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTC1Q2NKJ3 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTC1Q2NKJ3 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CTC1Q2NKJ3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTC1Q2NKJ3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTC1Q2NKJ3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTC1Q2NKJ3 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTC1Q2NKJ3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTC1Q2NKJ3 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTC1Q2NKJ3 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTC1Q2NKJ3 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTC1Q2NKJ3 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CTC1Q2NKJ3 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTC1Q2NKJ3 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTC1Q2NKJ3 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTC1Q2NKJ3 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTC1Q2NKJ3 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTC1Q2NKJ3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTC1Q2NKJ3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTC1Q2NKJ3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTC1Q2NKJ3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTC1Q2NKJ3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTC1Q2NKJ3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTC1Q2NKJ3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTC1Q2NKJ3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTC1Q2NKJ3 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CTC1Q2NKJ3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTC1Q2NKJ3 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTC1Q2NKJ3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTC1Q2NKJ3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTC1Q2NKJ3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTC1Q2NKJ3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTC1Q2NKJ3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTC1Q2NKJ3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTC1Q2NKJ3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTC1Q2NKJ3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTC1Q2NKJ3 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTC1Q2NKJ3 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTC1Q2NKJ3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CTC1Q2NKJ3 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTC1Q2NKJ3 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CTC1Q2NKJ3 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTC1Q2NKJ3 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms