Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB8

LONRF1, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 1, humanhuman

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Length 773 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONRF1Q17RB8 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LONRF1Q17RB8 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LONRF1Q17RB8 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LONRF1Q17RB8 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LONRF1Q17RB8 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LONRF1Q17RB8 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LONRF1Q17RB8 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LONRF1Q17RB8 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LONRF1Q17RB8 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LONRF1Q17RB8 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LONRF1Q17RB8 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LONRF1Q17RB8 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LONRF1Q17RB8 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LONRF1Q17RB8 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LONRF1Q17RB8 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LONRF1Q17RB8 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LONRF1Q17RB8 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LONRF1Q17RB8 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
LONRF1Q17RB8 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LONRF1Q17RB8 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LONRF1Q17RB8 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LONRF1Q17RB8 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LONRF1Q17RB8 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LONRF1Q17RB8 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LONRF1Q17RB8 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LONRF1Q17RB8 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LONRF1Q17RB8 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LONRF1Q17RB8 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LONRF1Q17RB8 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LONRF1Q17RB8 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LONRF1Q17RB8 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LONRF1Q17RB8 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LONRF1Q17RB8 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LONRF1Q17RB8 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LONRF1Q17RB8 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LONRF1Q17RB8 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LONRF1Q17RB8 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LONRF1Q17RB8 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LONRF1Q17RB8 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LONRF1Q17RB8 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LONRF1Q17RB8 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LONRF1Q17RB8 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LONRF1Q17RB8 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LONRF1Q17RB8 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LONRF1Q17RB8 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LONRF1Q17RB8 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LONRF1Q17RB8 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LONRF1Q17RB8 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LONRF1Q17RB8 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LONRF1Q17RB8 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LONRF1Q17RB8 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LONRF1Q17RB8 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LONRF1Q17RB8 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LONRF1Q17RB8 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LONRF1Q17RB8 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LONRF1Q17RB8 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LONRF1Q17RB8 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LONRF1Q17RB8 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LONRF1Q17RB8 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LONRF1Q17RB8 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LONRF1Q17RB8 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LONRF1Q17RB8 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LONRF1Q17RB8 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LONRF1Q17RB8 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
LONRF1Q17RB8 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
LONRF1Q17RB8 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
LONRF1Q17RB8 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LONRF1Q17RB8 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LONRF1Q17RB8 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LONRF1Q17RB8 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LONRF1Q17RB8 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
LONRF1Q17RB8 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
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LONRF1Q17RB8 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LONRF1Q17RB8 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LONRF1Q17RB8 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LONRF1Q17RB8 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LONRF1Q17RB8 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LONRF1Q17RB8 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LONRF1Q17RB8 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LONRF1Q17RB8 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LONRF1Q17RB8 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LONRF1Q17RB8 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LONRF1Q17RB8 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LONRF1Q17RB8 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LONRF1Q17RB8 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LONRF1Q17RB8 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LONRF1Q17RB8 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LONRF1Q17RB8 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LONRF1Q17RB8 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LONRF1Q17RB8 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LONRF1Q17RB8 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LONRF1Q17RB8 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LONRF1Q17RB8 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LONRF1Q17RB8 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LONRF1Q17RB8 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LONRF1Q17RB8 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LONRF1Q17RB8 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LONRF1Q17RB8 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LONRF1Q17RB8 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
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