Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM187BQ17R55 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM187BQ17R55 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM187BQ17R55 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM187BQ17R55 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FAM187BQ17R55 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
FAM187BQ17R55 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
FAM187BQ17R55 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FAM187BQ17R55 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
FAM187BQ17R55 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FAM187BQ17R55 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
FAM187BQ17R55 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24■■□□□ 1.43
FAM187BQ17R55 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
FAM187BQ17R55 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FAM187BQ17R55 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
FAM187BQ17R55 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24■■□□□ 1.43
FAM187BQ17R55 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
FAM187BQ17R55 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM187BQ17R55 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM187BQ17R55 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM187BQ17R55 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM187BQ17R55 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM187BQ17R55 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM187BQ17R55 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM187BQ17R55 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM187BQ17R55 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM187BQ17R55 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM187BQ17R55 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM187BQ17R55 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM187BQ17R55 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM187BQ17R55 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM187BQ17R55 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM187BQ17R55 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM187BQ17R55 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM187BQ17R55 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM187BQ17R55 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM187BQ17R55 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FAM187BQ17R55 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FAM187BQ17R55 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FAM187BQ17R55 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FAM187BQ17R55 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FAM187BQ17R55 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FAM187BQ17R55 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FAM187BQ17R55 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FAM187BQ17R55 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM187BQ17R55 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM187BQ17R55 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM187BQ17R55 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM187BQ17R55 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM187BQ17R55 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM187BQ17R55 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM187BQ17R55 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM187BQ17R55 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM187BQ17R55 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM187BQ17R55 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM187BQ17R55 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
FAM187BQ17R55 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
FAM187BQ17R55 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FAM187BQ17R55 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FAM187BQ17R55 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FAM187BQ17R55 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FAM187BQ17R55 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
FAM187BQ17R55 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FAM187BQ17R55 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
FAM187BQ17R55 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
FAM187BQ17R55 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FAM187BQ17R55 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM187BQ17R55 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM187BQ17R55 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM187BQ17R55 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM187BQ17R55 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM187BQ17R55 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM187BQ17R55 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM187BQ17R55 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM187BQ17R55 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM187BQ17R55 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM187BQ17R55 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM187BQ17R55 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM187BQ17R55 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM187BQ17R55 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM187BQ17R55 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM187BQ17R55 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM187BQ17R55 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM187BQ17R55 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM187BQ17R55 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM187BQ17R55 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM187BQ17R55 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM187BQ17R55 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM187BQ17R55 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM187BQ17R55 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM187BQ17R55 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM187BQ17R55 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM187BQ17R55 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM187BQ17R55 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM187BQ17R55 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM187BQ17R55 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM187BQ17R55 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM187BQ17R55 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM187BQ17R55 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM187BQ17R55 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
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