Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NDUFA9Q16795 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NDUFA9Q16795 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
NDUFA9Q16795 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
NDUFA9Q16795 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
NDUFA9Q16795 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NDUFA9Q16795 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NDUFA9Q16795 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NDUFA9Q16795 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NDUFA9Q16795 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
NDUFA9Q16795 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NDUFA9Q16795 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
NDUFA9Q16795 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NDUFA9Q16795 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NDUFA9Q16795 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
NDUFA9Q16795 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NDUFA9Q16795 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NDUFA9Q16795 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NDUFA9Q16795 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NDUFA9Q16795 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NDUFA9Q16795 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
NDUFA9Q16795 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NDUFA9Q16795 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21■□□□□ 0.95
NDUFA9Q16795 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
NDUFA9Q16795 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NDUFA9Q16795 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NDUFA9Q16795 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NDUFA9Q16795 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NDUFA9Q16795 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NDUFA9Q16795 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NDUFA9Q16795 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NDUFA9Q16795 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NDUFA9Q16795 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NDUFA9Q16795 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NDUFA9Q16795 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NDUFA9Q16795 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NDUFA9Q16795 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NDUFA9Q16795 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
NDUFA9Q16795 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NDUFA9Q16795 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NDUFA9Q16795 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
NDUFA9Q16795 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NDUFA9Q16795 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NDUFA9Q16795 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NDUFA9Q16795 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NDUFA9Q16795 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NDUFA9Q16795 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
NDUFA9Q16795 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NDUFA9Q16795 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NDUFA9Q16795 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NDUFA9Q16795 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
NDUFA9Q16795 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NDUFA9Q16795 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NDUFA9Q16795 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NDUFA9Q16795 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NDUFA9Q16795 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NDUFA9Q16795 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NDUFA9Q16795 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NDUFA9Q16795 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NDUFA9Q16795 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NDUFA9Q16795 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NDUFA9Q16795 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NDUFA9Q16795 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NDUFA9Q16795 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NDUFA9Q16795 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NDUFA9Q16795 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NDUFA9Q16795 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
NDUFA9Q16795 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
NDUFA9Q16795 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NDUFA9Q16795 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NDUFA9Q16795 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NDUFA9Q16795 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NDUFA9Q16795 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NDUFA9Q16795 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NDUFA9Q16795 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NDUFA9Q16795 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NDUFA9Q16795 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NDUFA9Q16795 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NDUFA9Q16795 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NDUFA9Q16795 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NDUFA9Q16795 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NDUFA9Q16795 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NDUFA9Q16795 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NDUFA9Q16795 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NDUFA9Q16795 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NDUFA9Q16795 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NDUFA9Q16795 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NDUFA9Q16795 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NDUFA9Q16795 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NDUFA9Q16795 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NDUFA9Q16795 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NDUFA9Q16795 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NDUFA9Q16795 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NDUFA9Q16795 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
NDUFA9Q16795 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
NDUFA9Q16795 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NDUFA9Q16795 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NDUFA9Q16795 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NDUFA9Q16795 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NDUFA9Q16795 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms