Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNAPC1Q16533 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNAPC1Q16533 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNAPC1Q16533 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SNAPC1Q16533 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNAPC1Q16533 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNAPC1Q16533 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNAPC1Q16533 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNAPC1Q16533 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNAPC1Q16533 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNAPC1Q16533 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNAPC1Q16533 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNAPC1Q16533 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNAPC1Q16533 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNAPC1Q16533 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNAPC1Q16533 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNAPC1Q16533 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SNAPC1Q16533 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNAPC1Q16533 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNAPC1Q16533 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNAPC1Q16533 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNAPC1Q16533 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNAPC1Q16533 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNAPC1Q16533 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNAPC1Q16533 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNAPC1Q16533 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNAPC1Q16533 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNAPC1Q16533 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNAPC1Q16533 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNAPC1Q16533 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNAPC1Q16533 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNAPC1Q16533 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNAPC1Q16533 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNAPC1Q16533 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNAPC1Q16533 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNAPC1Q16533 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNAPC1Q16533 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNAPC1Q16533 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNAPC1Q16533 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNAPC1Q16533 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNAPC1Q16533 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNAPC1Q16533 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SNAPC1Q16533 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNAPC1Q16533 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNAPC1Q16533 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNAPC1Q16533 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNAPC1Q16533 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNAPC1Q16533 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNAPC1Q16533 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNAPC1Q16533 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNAPC1Q16533 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNAPC1Q16533 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNAPC1Q16533 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNAPC1Q16533 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SNAPC1Q16533 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNAPC1Q16533 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNAPC1Q16533 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNAPC1Q16533 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNAPC1Q16533 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNAPC1Q16533 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNAPC1Q16533 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNAPC1Q16533 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SNAPC1Q16533 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNAPC1Q16533 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNAPC1Q16533 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNAPC1Q16533 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNAPC1Q16533 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNAPC1Q16533 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNAPC1Q16533 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNAPC1Q16533 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SNAPC1Q16533 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SNAPC1Q16533 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNAPC1Q16533 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNAPC1Q16533 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNAPC1Q16533 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
SNAPC1Q16533 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNAPC1Q16533 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNAPC1Q16533 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNAPC1Q16533 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNAPC1Q16533 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNAPC1Q16533 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNAPC1Q16533 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNAPC1Q16533 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNAPC1Q16533 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNAPC1Q16533 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
SNAPC1Q16533 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNAPC1Q16533 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNAPC1Q16533 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNAPC1Q16533 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNAPC1Q16533 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNAPC1Q16533 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNAPC1Q16533 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNAPC1Q16533 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNAPC1Q16533 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNAPC1Q16533 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNAPC1Q16533 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNAPC1Q16533 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNAPC1Q16533 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNAPC1Q16533 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNAPC1Q16533 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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