Protein–RNA interactions for Protein: Q16342

PDCD2, Programmed cell death protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD2Q16342 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDCD2Q16342 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDCD2Q16342 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDCD2Q16342 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDCD2Q16342 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDCD2Q16342 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDCD2Q16342 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDCD2Q16342 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDCD2Q16342 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDCD2Q16342 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PDCD2Q16342 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDCD2Q16342 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDCD2Q16342 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDCD2Q16342 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDCD2Q16342 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDCD2Q16342 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDCD2Q16342 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDCD2Q16342 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDCD2Q16342 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDCD2Q16342 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDCD2Q16342 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDCD2Q16342 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDCD2Q16342 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDCD2Q16342 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDCD2Q16342 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDCD2Q16342 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PDCD2Q16342 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDCD2Q16342 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDCD2Q16342 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDCD2Q16342 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDCD2Q16342 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDCD2Q16342 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PDCD2Q16342 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDCD2Q16342 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PDCD2Q16342 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDCD2Q16342 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDCD2Q16342 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDCD2Q16342 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDCD2Q16342 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDCD2Q16342 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDCD2Q16342 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDCD2Q16342 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDCD2Q16342 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDCD2Q16342 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDCD2Q16342 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDCD2Q16342 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PDCD2Q16342 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDCD2Q16342 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDCD2Q16342 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDCD2Q16342 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDCD2Q16342 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDCD2Q16342 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDCD2Q16342 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDCD2Q16342 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDCD2Q16342 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDCD2Q16342 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDCD2Q16342 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDCD2Q16342 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDCD2Q16342 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDCD2Q16342 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDCD2Q16342 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDCD2Q16342 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDCD2Q16342 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDCD2Q16342 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDCD2Q16342 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDCD2Q16342 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDCD2Q16342 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDCD2Q16342 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDCD2Q16342 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PDCD2Q16342 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDCD2Q16342 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDCD2Q16342 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PDCD2Q16342 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDCD2Q16342 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDCD2Q16342 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PDCD2Q16342 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PDCD2Q16342 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PDCD2Q16342 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PDCD2Q16342 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PDCD2Q16342 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDCD2Q16342 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDCD2Q16342 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDCD2Q16342 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDCD2Q16342 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDCD2Q16342 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDCD2Q16342 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDCD2Q16342 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDCD2Q16342 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDCD2Q16342 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PDCD2Q16342 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDCD2Q16342 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDCD2Q16342 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDCD2Q16342 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDCD2Q16342 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDCD2Q16342 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDCD2Q16342 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDCD2Q16342 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PDCD2Q16342 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDCD2Q16342 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDCD2Q16342 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
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