Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIX1Q15475 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIX1Q15475 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SIX1Q15475 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIX1Q15475 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIX1Q15475 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIX1Q15475 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIX1Q15475 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIX1Q15475 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIX1Q15475 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIX1Q15475 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIX1Q15475 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIX1Q15475 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIX1Q15475 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIX1Q15475 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIX1Q15475 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIX1Q15475 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIX1Q15475 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIX1Q15475 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIX1Q15475 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIX1Q15475 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIX1Q15475 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIX1Q15475 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIX1Q15475 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIX1Q15475 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIX1Q15475 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIX1Q15475 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIX1Q15475 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SIX1Q15475 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIX1Q15475 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIX1Q15475 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIX1Q15475 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIX1Q15475 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIX1Q15475 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIX1Q15475 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIX1Q15475 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIX1Q15475 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIX1Q15475 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIX1Q15475 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SIX1Q15475 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIX1Q15475 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIX1Q15475 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIX1Q15475 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIX1Q15475 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIX1Q15475 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIX1Q15475 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIX1Q15475 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIX1Q15475 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIX1Q15475 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIX1Q15475 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIX1Q15475 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIX1Q15475 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIX1Q15475 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIX1Q15475 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIX1Q15475 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIX1Q15475 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIX1Q15475 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIX1Q15475 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIX1Q15475 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIX1Q15475 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIX1Q15475 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SIX1Q15475 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIX1Q15475 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SIX1Q15475 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIX1Q15475 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIX1Q15475 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIX1Q15475 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SIX1Q15475 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIX1Q15475 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIX1Q15475 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIX1Q15475 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIX1Q15475 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIX1Q15475 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIX1Q15475 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIX1Q15475 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIX1Q15475 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIX1Q15475 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SIX1Q15475 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIX1Q15475 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIX1Q15475 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIX1Q15475 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIX1Q15475 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIX1Q15475 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIX1Q15475 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIX1Q15475 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIX1Q15475 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIX1Q15475 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIX1Q15475 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIX1Q15475 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIX1Q15475 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIX1Q15475 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIX1Q15475 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIX1Q15475 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIX1Q15475 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIX1Q15475 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIX1Q15475 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SIX1Q15475 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIX1Q15475 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIX1Q15475 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIX1Q15475 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
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