Protein–RNA interactions for Protein: Q15349

RPS6KA2, Ribosomal protein S6 kinase alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KA2Q15349 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPS6KA2Q15349 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPS6KA2Q15349 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPS6KA2Q15349 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPS6KA2Q15349 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPS6KA2Q15349 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPS6KA2Q15349 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPS6KA2Q15349 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPS6KA2Q15349 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPS6KA2Q15349 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPS6KA2Q15349 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RPS6KA2Q15349 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPS6KA2Q15349 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPS6KA2Q15349 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPS6KA2Q15349 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPS6KA2Q15349 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPS6KA2Q15349 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPS6KA2Q15349 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPS6KA2Q15349 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPS6KA2Q15349 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPS6KA2Q15349 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPS6KA2Q15349 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPS6KA2Q15349 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPS6KA2Q15349 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RPS6KA2Q15349 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPS6KA2Q15349 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPS6KA2Q15349 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPS6KA2Q15349 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPS6KA2Q15349 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPS6KA2Q15349 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPS6KA2Q15349 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPS6KA2Q15349 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPS6KA2Q15349 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPS6KA2Q15349 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPS6KA2Q15349 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPS6KA2Q15349 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RPS6KA2Q15349 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RPS6KA2Q15349 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RPS6KA2Q15349 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RPS6KA2Q15349 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
RPS6KA2Q15349 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPS6KA2Q15349 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPS6KA2Q15349 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPS6KA2Q15349 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPS6KA2Q15349 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPS6KA2Q15349 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPS6KA2Q15349 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPS6KA2Q15349 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPS6KA2Q15349 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPS6KA2Q15349 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPS6KA2Q15349 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RPS6KA2Q15349 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPS6KA2Q15349 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPS6KA2Q15349 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPS6KA2Q15349 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPS6KA2Q15349 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPS6KA2Q15349 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPS6KA2Q15349 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPS6KA2Q15349 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPS6KA2Q15349 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPS6KA2Q15349 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPS6KA2Q15349 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPS6KA2Q15349 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPS6KA2Q15349 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPS6KA2Q15349 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPS6KA2Q15349 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPS6KA2Q15349 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPS6KA2Q15349 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPS6KA2Q15349 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPS6KA2Q15349 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPS6KA2Q15349 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPS6KA2Q15349 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPS6KA2Q15349 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RPS6KA2Q15349 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPS6KA2Q15349 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPS6KA2Q15349 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RPS6KA2Q15349 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPS6KA2Q15349 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPS6KA2Q15349 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPS6KA2Q15349 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPS6KA2Q15349 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPS6KA2Q15349 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPS6KA2Q15349 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPS6KA2Q15349 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPS6KA2Q15349 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPS6KA2Q15349 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPS6KA2Q15349 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPS6KA2Q15349 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPS6KA2Q15349 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPS6KA2Q15349 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPS6KA2Q15349 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPS6KA2Q15349 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPS6KA2Q15349 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPS6KA2Q15349 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPS6KA2Q15349 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPS6KA2Q15349 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPS6KA2Q15349 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPS6KA2Q15349 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPS6KA2Q15349 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPS6KA2Q15349 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms