Protein–RNA interactions for Protein: Q15198

PDGFRL, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRLQ15198 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDGFRLQ15198 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDGFRLQ15198 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PDGFRLQ15198 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDGFRLQ15198 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDGFRLQ15198 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDGFRLQ15198 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDGFRLQ15198 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDGFRLQ15198 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDGFRLQ15198 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDGFRLQ15198 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDGFRLQ15198 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDGFRLQ15198 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDGFRLQ15198 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDGFRLQ15198 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDGFRLQ15198 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDGFRLQ15198 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDGFRLQ15198 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDGFRLQ15198 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDGFRLQ15198 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDGFRLQ15198 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDGFRLQ15198 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDGFRLQ15198 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDGFRLQ15198 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDGFRLQ15198 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDGFRLQ15198 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDGFRLQ15198 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDGFRLQ15198 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDGFRLQ15198 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDGFRLQ15198 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDGFRLQ15198 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDGFRLQ15198 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDGFRLQ15198 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDGFRLQ15198 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDGFRLQ15198 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDGFRLQ15198 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDGFRLQ15198 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDGFRLQ15198 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDGFRLQ15198 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDGFRLQ15198 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDGFRLQ15198 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDGFRLQ15198 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDGFRLQ15198 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDGFRLQ15198 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDGFRLQ15198 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDGFRLQ15198 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDGFRLQ15198 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDGFRLQ15198 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDGFRLQ15198 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDGFRLQ15198 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDGFRLQ15198 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDGFRLQ15198 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDGFRLQ15198 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDGFRLQ15198 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDGFRLQ15198 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDGFRLQ15198 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDGFRLQ15198 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDGFRLQ15198 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDGFRLQ15198 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDGFRLQ15198 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDGFRLQ15198 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PDGFRLQ15198 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDGFRLQ15198 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDGFRLQ15198 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDGFRLQ15198 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDGFRLQ15198 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDGFRLQ15198 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDGFRLQ15198 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDGFRLQ15198 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDGFRLQ15198 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDGFRLQ15198 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDGFRLQ15198 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDGFRLQ15198 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDGFRLQ15198 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDGFRLQ15198 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDGFRLQ15198 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDGFRLQ15198 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDGFRLQ15198 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDGFRLQ15198 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PDGFRLQ15198 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PDGFRLQ15198 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDGFRLQ15198 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDGFRLQ15198 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDGFRLQ15198 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDGFRLQ15198 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PDGFRLQ15198 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PDGFRLQ15198 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDGFRLQ15198 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PDGFRLQ15198 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PDGFRLQ15198 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDGFRLQ15198 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDGFRLQ15198 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDGFRLQ15198 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDGFRLQ15198 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDGFRLQ15198 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDGFRLQ15198 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDGFRLQ15198 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDGFRLQ15198 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDGFRLQ15198 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDGFRLQ15198 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
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