Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSMD6Q15008 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSMD6Q15008 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSMD6Q15008 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSMD6Q15008 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PSMD6Q15008 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSMD6Q15008 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSMD6Q15008 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSMD6Q15008 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSMD6Q15008 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSMD6Q15008 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSMD6Q15008 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PSMD6Q15008 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PSMD6Q15008 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PSMD6Q15008 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PSMD6Q15008 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PSMD6Q15008 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PSMD6Q15008 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PSMD6Q15008 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PSMD6Q15008 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PSMD6Q15008 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PSMD6Q15008 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PSMD6Q15008 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PSMD6Q15008 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PSMD6Q15008 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PSMD6Q15008 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PSMD6Q15008 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PSMD6Q15008 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PSMD6Q15008 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PSMD6Q15008 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PSMD6Q15008 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PSMD6Q15008 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PSMD6Q15008 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PSMD6Q15008 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PSMD6Q15008 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PSMD6Q15008 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PSMD6Q15008 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PSMD6Q15008 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PSMD6Q15008 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PSMD6Q15008 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PSMD6Q15008 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PSMD6Q15008 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PSMD6Q15008 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PSMD6Q15008 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PSMD6Q15008 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PSMD6Q15008 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PSMD6Q15008 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PSMD6Q15008 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PSMD6Q15008 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PSMD6Q15008 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PSMD6Q15008 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PSMD6Q15008 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PSMD6Q15008 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PSMD6Q15008 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PSMD6Q15008 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PSMD6Q15008 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
PSMD6Q15008 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PSMD6Q15008 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PSMD6Q15008 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PSMD6Q15008 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PSMD6Q15008 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PSMD6Q15008 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PSMD6Q15008 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PSMD6Q15008 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PSMD6Q15008 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PSMD6Q15008 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PSMD6Q15008 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PSMD6Q15008 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PSMD6Q15008 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PSMD6Q15008 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PSMD6Q15008 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PSMD6Q15008 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PSMD6Q15008 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PSMD6Q15008 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PSMD6Q15008 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PSMD6Q15008 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PSMD6Q15008 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PSMD6Q15008 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PSMD6Q15008 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PSMD6Q15008 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PSMD6Q15008 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PSMD6Q15008 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PSMD6Q15008 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PSMD6Q15008 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PSMD6Q15008 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PSMD6Q15008 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PSMD6Q15008 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PSMD6Q15008 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PSMD6Q15008 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PSMD6Q15008 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PSMD6Q15008 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PSMD6Q15008 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PSMD6Q15008 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PSMD6Q15008 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PSMD6Q15008 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PSMD6Q15008 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PSMD6Q15008 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PSMD6Q15008 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PSMD6Q15008 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PSMD6Q15008 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms