Protein–RNA interactions for Protein: Q14690

PDCD11, Protein RRP5 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,871 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD11Q14690 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PDCD11Q14690 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDCD11Q14690 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDCD11Q14690 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDCD11Q14690 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PDCD11Q14690 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDCD11Q14690 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDCD11Q14690 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDCD11Q14690 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDCD11Q14690 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDCD11Q14690 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDCD11Q14690 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDCD11Q14690 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDCD11Q14690 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDCD11Q14690 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDCD11Q14690 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDCD11Q14690 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDCD11Q14690 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDCD11Q14690 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDCD11Q14690 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PDCD11Q14690 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDCD11Q14690 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PDCD11Q14690 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PDCD11Q14690 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PDCD11Q14690 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PDCD11Q14690 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PDCD11Q14690 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PDCD11Q14690 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDCD11Q14690 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDCD11Q14690 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDCD11Q14690 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDCD11Q14690 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDCD11Q14690 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDCD11Q14690 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDCD11Q14690 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDCD11Q14690 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDCD11Q14690 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDCD11Q14690 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDCD11Q14690 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDCD11Q14690 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDCD11Q14690 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDCD11Q14690 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDCD11Q14690 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDCD11Q14690 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDCD11Q14690 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PDCD11Q14690 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDCD11Q14690 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDCD11Q14690 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDCD11Q14690 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDCD11Q14690 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDCD11Q14690 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDCD11Q14690 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDCD11Q14690 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PDCD11Q14690 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDCD11Q14690 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDCD11Q14690 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDCD11Q14690 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDCD11Q14690 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDCD11Q14690 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDCD11Q14690 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDCD11Q14690 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDCD11Q14690 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDCD11Q14690 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDCD11Q14690 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDCD11Q14690 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDCD11Q14690 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PDCD11Q14690 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDCD11Q14690 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PDCD11Q14690 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDCD11Q14690 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDCD11Q14690 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDCD11Q14690 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDCD11Q14690 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDCD11Q14690 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDCD11Q14690 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDCD11Q14690 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PDCD11Q14690 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDCD11Q14690 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDCD11Q14690 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDCD11Q14690 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDCD11Q14690 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDCD11Q14690 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDCD11Q14690 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDCD11Q14690 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDCD11Q14690 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PDCD11Q14690 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PDCD11Q14690 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PDCD11Q14690 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PDCD11Q14690 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDCD11Q14690 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDCD11Q14690 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDCD11Q14690 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDCD11Q14690 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDCD11Q14690 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDCD11Q14690 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDCD11Q14690 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PDCD11Q14690 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDCD11Q14690 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDCD11Q14690 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDCD11Q14690 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
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