Protein–RNA interactions for Protein: Q14498

RBM39, RNA-binding protein 39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 530 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39Q14498 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
RBM39Q14498 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
RBM39Q14498 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RBM39Q14498 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RBM39Q14498 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RBM39Q14498 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RBM39Q14498 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RBM39Q14498 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RBM39Q14498 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RBM39Q14498 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RBM39Q14498 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RBM39Q14498 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RBM39Q14498 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RBM39Q14498 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RBM39Q14498 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RBM39Q14498 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RBM39Q14498 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RBM39Q14498 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RBM39Q14498 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RBM39Q14498 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RBM39Q14498 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RBM39Q14498 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RBM39Q14498 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RBM39Q14498 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RBM39Q14498 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RBM39Q14498 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RBM39Q14498 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RBM39Q14498 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RBM39Q14498 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RBM39Q14498 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RBM39Q14498 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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