Protein–RNA interactions for Protein: Q14498

RBM39, RNA-binding protein 39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39Q14498 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RBM39Q14498 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
RBM39Q14498 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
RBM39Q14498 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RBM39Q14498 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RBM39Q14498 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RBM39Q14498 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RBM39Q14498 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RBM39Q14498 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RBM39Q14498 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RBM39Q14498 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RBM39Q14498 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RBM39Q14498 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RBM39Q14498 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RBM39Q14498 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RBM39Q14498 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RBM39Q14498 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RBM39Q14498 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RBM39Q14498 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RBM39Q14498 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RBM39Q14498 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RBM39Q14498 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RBM39Q14498 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RBM39Q14498 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RBM39Q14498 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RBM39Q14498 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RBM39Q14498 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RBM39Q14498 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RBM39Q14498 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RBM39Q14498 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RBM39Q14498 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RBM39Q14498 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms