Protein–RNA interactions for Protein: Q14088

RAB33A, Ras-related protein Rab-33A, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB33AQ14088 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB33AQ14088 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB33AQ14088 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB33AQ14088 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB33AQ14088 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB33AQ14088 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB33AQ14088 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB33AQ14088 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB33AQ14088 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB33AQ14088 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB33AQ14088 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB33AQ14088 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB33AQ14088 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB33AQ14088 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB33AQ14088 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB33AQ14088 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB33AQ14088 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB33AQ14088 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB33AQ14088 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB33AQ14088 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB33AQ14088 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB33AQ14088 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB33AQ14088 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB33AQ14088 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB33AQ14088 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB33AQ14088 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB33AQ14088 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB33AQ14088 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB33AQ14088 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB33AQ14088 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB33AQ14088 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB33AQ14088 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB33AQ14088 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB33AQ14088 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB33AQ14088 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB33AQ14088 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB33AQ14088 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB33AQ14088 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB33AQ14088 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB33AQ14088 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB33AQ14088 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB33AQ14088 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB33AQ14088 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB33AQ14088 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB33AQ14088 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB33AQ14088 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB33AQ14088 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB33AQ14088 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB33AQ14088 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB33AQ14088 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB33AQ14088 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB33AQ14088 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB33AQ14088 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB33AQ14088 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB33AQ14088 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB33AQ14088 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB33AQ14088 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB33AQ14088 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB33AQ14088 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB33AQ14088 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB33AQ14088 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB33AQ14088 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB33AQ14088 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB33AQ14088 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB33AQ14088 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB33AQ14088 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB33AQ14088 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB33AQ14088 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB33AQ14088 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB33AQ14088 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB33AQ14088 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB33AQ14088 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB33AQ14088 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB33AQ14088 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB33AQ14088 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB33AQ14088 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB33AQ14088 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB33AQ14088 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB33AQ14088 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB33AQ14088 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB33AQ14088 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB33AQ14088 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB33AQ14088 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB33AQ14088 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB33AQ14088 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB33AQ14088 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB33AQ14088 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB33AQ14088 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB33AQ14088 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB33AQ14088 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB33AQ14088 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB33AQ14088 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB33AQ14088 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB33AQ14088 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB33AQ14088 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB33AQ14088 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB33AQ14088 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB33AQ14088 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB33AQ14088 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB33AQ14088 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
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