Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Length 980 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PEX6Q13608 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PEX6Q13608 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PEX6Q13608 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PEX6Q13608 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PEX6Q13608 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PEX6Q13608 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PEX6Q13608 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PEX6Q13608 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PEX6Q13608 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PEX6Q13608 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PEX6Q13608 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PEX6Q13608 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PEX6Q13608 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PEX6Q13608 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PEX6Q13608 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PEX6Q13608 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PEX6Q13608 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PEX6Q13608 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PEX6Q13608 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PEX6Q13608 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PEX6Q13608 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PEX6Q13608 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PEX6Q13608 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PEX6Q13608 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PEX6Q13608 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PEX6Q13608 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PEX6Q13608 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PEX6Q13608 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PEX6Q13608 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PEX6Q13608 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PEX6Q13608 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PEX6Q13608 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PEX6Q13608 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PEX6Q13608 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PEX6Q13608 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PEX6Q13608 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PEX6Q13608 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PEX6Q13608 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PEX6Q13608 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PEX6Q13608 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PEX6Q13608 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PEX6Q13608 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PEX6Q13608 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PEX6Q13608 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PEX6Q13608 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PEX6Q13608 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PEX6Q13608 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PEX6Q13608 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PEX6Q13608 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PEX6Q13608 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PEX6Q13608 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PEX6Q13608 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PEX6Q13608 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PEX6Q13608 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PEX6Q13608 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PEX6Q13608 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PEX6Q13608 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PEX6Q13608 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PEX6Q13608 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PEX6Q13608 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PEX6Q13608 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PEX6Q13608 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PEX6Q13608 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PEX6Q13608 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PEX6Q13608 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PEX6Q13608 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PEX6Q13608 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PEX6Q13608 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PEX6Q13608 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PEX6Q13608 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PEX6Q13608 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PEX6Q13608 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PEX6Q13608 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PEX6Q13608 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PEX6Q13608 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PEX6Q13608 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PEX6Q13608 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PEX6Q13608 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PEX6Q13608 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PEX6Q13608 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PEX6Q13608 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PEX6Q13608 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PEX6Q13608 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PEX6Q13608 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PEX6Q13608 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PEX6Q13608 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PEX6Q13608 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PEX6Q13608 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PEX6Q13608 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PEX6Q13608 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PEX6Q13608 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PEX6Q13608 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PEX6Q13608 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PEX6Q13608 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PEX6Q13608 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PEX6Q13608 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PEX6Q13608 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PEX6Q13608 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PEX6Q13608 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
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