Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
HDAC1Q13547 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
HDAC1Q13547 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
HDAC1Q13547 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HDAC1Q13547 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HDAC1Q13547 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HDAC1Q13547 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HDAC1Q13547 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HDAC1Q13547 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HDAC1Q13547 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
HDAC1Q13547 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HDAC1Q13547 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HDAC1Q13547 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HDAC1Q13547 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HDAC1Q13547 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
HDAC1Q13547 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
HDAC1Q13547 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
HDAC1Q13547 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HDAC1Q13547 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HDAC1Q13547 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
HDAC1Q13547 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
HDAC1Q13547 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HDAC1Q13547 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
HDAC1Q13547 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
HDAC1Q13547 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
HDAC1Q13547 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HDAC1Q13547 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HDAC1Q13547 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
HDAC1Q13547 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HDAC1Q13547 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
HDAC1Q13547 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
HDAC1Q13547 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
HDAC1Q13547 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
HDAC1Q13547 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
HDAC1Q13547 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
HDAC1Q13547 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
HDAC1Q13547 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
HDAC1Q13547 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
HDAC1Q13547 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
HDAC1Q13547 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
HDAC1Q13547 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
HDAC1Q13547 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
HDAC1Q13547 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
HDAC1Q13547 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
HDAC1Q13547 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HDAC1Q13547 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HDAC1Q13547 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
HDAC1Q13547 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HDAC1Q13547 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
HDAC1Q13547 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
HDAC1Q13547 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
HDAC1Q13547 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HDAC1Q13547 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HDAC1Q13547 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
HDAC1Q13547 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
HDAC1Q13547 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
HDAC1Q13547 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
HDAC1Q13547 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HDAC1Q13547 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HDAC1Q13547 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HDAC1Q13547 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
HDAC1Q13547 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HDAC1Q13547 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HDAC1Q13547 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
HDAC1Q13547 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HDAC1Q13547 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
HDAC1Q13547 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HDAC1Q13547 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
HDAC1Q13547 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HDAC1Q13547 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
HDAC1Q13547 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HDAC1Q13547 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
HDAC1Q13547 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
HDAC1Q13547 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
HDAC1Q13547 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HDAC1Q13547 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
HDAC1Q13547 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
HDAC1Q13547 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
HDAC1Q13547 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
HDAC1Q13547 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HDAC1Q13547 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HDAC1Q13547 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HDAC1Q13547 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HDAC1Q13547 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HDAC1Q13547 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HDAC1Q13547 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HDAC1Q13547 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HDAC1Q13547 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HDAC1Q13547 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HDAC1Q13547 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HDAC1Q13547 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HDAC1Q13547 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HDAC1Q13547 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HDAC1Q13547 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HDAC1Q13547 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
HDAC1Q13547 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
HDAC1Q13547 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
HDAC1Q13547 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
HDAC1Q13547 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
HDAC1Q13547 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
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