Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PICALMQ13492 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PICALMQ13492 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PICALMQ13492 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PICALMQ13492 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PICALMQ13492 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PICALMQ13492 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PICALMQ13492 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PICALMQ13492 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PICALMQ13492 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PICALMQ13492 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PICALMQ13492 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PICALMQ13492 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PICALMQ13492 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PICALMQ13492 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
PICALMQ13492 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PICALMQ13492 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PICALMQ13492 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PICALMQ13492 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PICALMQ13492 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PICALMQ13492 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PICALMQ13492 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
PICALMQ13492 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PICALMQ13492 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PICALMQ13492 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PICALMQ13492 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PICALMQ13492 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PICALMQ13492 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PICALMQ13492 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PICALMQ13492 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PICALMQ13492 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
PICALMQ13492 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PICALMQ13492 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PICALMQ13492 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PICALMQ13492 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PICALMQ13492 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PICALMQ13492 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PICALMQ13492 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PICALMQ13492 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PICALMQ13492 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PICALMQ13492 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PICALMQ13492 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PICALMQ13492 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PICALMQ13492 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PICALMQ13492 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PICALMQ13492 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PICALMQ13492 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PICALMQ13492 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PICALMQ13492 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PICALMQ13492 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PICALMQ13492 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PICALMQ13492 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PICALMQ13492 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PICALMQ13492 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PICALMQ13492 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PICALMQ13492 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PICALMQ13492 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PICALMQ13492 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PICALMQ13492 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PICALMQ13492 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PICALMQ13492 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PICALMQ13492 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PICALMQ13492 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PICALMQ13492 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PICALMQ13492 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PICALMQ13492 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PICALMQ13492 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PICALMQ13492 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PICALMQ13492 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PICALMQ13492 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PICALMQ13492 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PICALMQ13492 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PICALMQ13492 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PICALMQ13492 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PICALMQ13492 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PICALMQ13492 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PICALMQ13492 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PICALMQ13492 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PICALMQ13492 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PICALMQ13492 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PICALMQ13492 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PICALMQ13492 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PICALMQ13492 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PICALMQ13492 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PICALMQ13492 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PICALMQ13492 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PICALMQ13492 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PICALMQ13492 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PICALMQ13492 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PICALMQ13492 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PICALMQ13492 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PICALMQ13492 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PICALMQ13492 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PICALMQ13492 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PICALMQ13492 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PICALMQ13492 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PICALMQ13492 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PICALMQ13492 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PICALMQ13492 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PICALMQ13492 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
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