Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMAD4Q13485 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMAD4Q13485 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMAD4Q13485 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMAD4Q13485 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SMAD4Q13485 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMAD4Q13485 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMAD4Q13485 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMAD4Q13485 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMAD4Q13485 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMAD4Q13485 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMAD4Q13485 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMAD4Q13485 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMAD4Q13485 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMAD4Q13485 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMAD4Q13485 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMAD4Q13485 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMAD4Q13485 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMAD4Q13485 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMAD4Q13485 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SMAD4Q13485 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SMAD4Q13485 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMAD4Q13485 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMAD4Q13485 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMAD4Q13485 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMAD4Q13485 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMAD4Q13485 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMAD4Q13485 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMAD4Q13485 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMAD4Q13485 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMAD4Q13485 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMAD4Q13485 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SMAD4Q13485 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMAD4Q13485 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMAD4Q13485 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMAD4Q13485 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMAD4Q13485 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMAD4Q13485 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMAD4Q13485 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMAD4Q13485 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMAD4Q13485 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMAD4Q13485 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMAD4Q13485 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMAD4Q13485 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMAD4Q13485 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMAD4Q13485 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMAD4Q13485 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SMAD4Q13485 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMAD4Q13485 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMAD4Q13485 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMAD4Q13485 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SMAD4Q13485 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMAD4Q13485 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMAD4Q13485 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMAD4Q13485 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMAD4Q13485 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMAD4Q13485 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMAD4Q13485 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMAD4Q13485 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMAD4Q13485 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMAD4Q13485 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMAD4Q13485 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SMAD4Q13485 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMAD4Q13485 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMAD4Q13485 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMAD4Q13485 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMAD4Q13485 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMAD4Q13485 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMAD4Q13485 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMAD4Q13485 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMAD4Q13485 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMAD4Q13485 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMAD4Q13485 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMAD4Q13485 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMAD4Q13485 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMAD4Q13485 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMAD4Q13485 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMAD4Q13485 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMAD4Q13485 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMAD4Q13485 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMAD4Q13485 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SMAD4Q13485 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMAD4Q13485 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMAD4Q13485 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMAD4Q13485 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMAD4Q13485 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMAD4Q13485 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SMAD4Q13485 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMAD4Q13485 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMAD4Q13485 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SMAD4Q13485 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMAD4Q13485 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMAD4Q13485 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMAD4Q13485 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMAD4Q13485 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMAD4Q13485 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMAD4Q13485 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMAD4Q13485 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMAD4Q13485 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SMAD4Q13485 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
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