Protein–RNA interactions for Protein: Q13445

TMED1, Transmembrane emp24 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED1Q13445 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMED1Q13445 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMED1Q13445 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMED1Q13445 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMED1Q13445 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMED1Q13445 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMED1Q13445 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMED1Q13445 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMED1Q13445 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMED1Q13445 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMED1Q13445 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMED1Q13445 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMED1Q13445 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMED1Q13445 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMED1Q13445 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMED1Q13445 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMED1Q13445 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMED1Q13445 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMED1Q13445 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMED1Q13445 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMED1Q13445 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMED1Q13445 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMED1Q13445 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMED1Q13445 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMED1Q13445 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMED1Q13445 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMED1Q13445 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMED1Q13445 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TMED1Q13445 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TMED1Q13445 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TMED1Q13445 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
TMED1Q13445 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMED1Q13445 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMED1Q13445 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMED1Q13445 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMED1Q13445 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMED1Q13445 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMED1Q13445 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMED1Q13445 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMED1Q13445 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMED1Q13445 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMED1Q13445 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
TMED1Q13445 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMED1Q13445 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMED1Q13445 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMED1Q13445 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMED1Q13445 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMED1Q13445 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMED1Q13445 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMED1Q13445 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMED1Q13445 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMED1Q13445 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMED1Q13445 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMED1Q13445 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
TMED1Q13445 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMED1Q13445 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMED1Q13445 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMED1Q13445 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMED1Q13445 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMED1Q13445 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMED1Q13445 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMED1Q13445 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMED1Q13445 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMED1Q13445 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMED1Q13445 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMED1Q13445 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMED1Q13445 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMED1Q13445 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMED1Q13445 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMED1Q13445 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMED1Q13445 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMED1Q13445 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMED1Q13445 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMED1Q13445 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMED1Q13445 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMED1Q13445 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMED1Q13445 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMED1Q13445 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMED1Q13445 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMED1Q13445 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMED1Q13445 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMED1Q13445 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TMED1Q13445 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TMED1Q13445 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMED1Q13445 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMED1Q13445 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMED1Q13445 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMED1Q13445 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMED1Q13445 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMED1Q13445 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMED1Q13445 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMED1Q13445 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMED1Q13445 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMED1Q13445 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMED1Q13445 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMED1Q13445 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMED1Q13445 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMED1Q13445 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMED1Q13445 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMED1Q13445 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms