Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SF3B2Q13435 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SF3B2Q13435 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
SF3B2Q13435 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SF3B2Q13435 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SF3B2Q13435 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
SF3B2Q13435 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SF3B2Q13435 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SF3B2Q13435 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SF3B2Q13435 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SF3B2Q13435 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SF3B2Q13435 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SF3B2Q13435 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SF3B2Q13435 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SF3B2Q13435 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
SF3B2Q13435 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SF3B2Q13435 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SF3B2Q13435 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SF3B2Q13435 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SF3B2Q13435 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SF3B2Q13435 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SF3B2Q13435 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
SF3B2Q13435 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SF3B2Q13435 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SF3B2Q13435 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SF3B2Q13435 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SF3B2Q13435 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SF3B2Q13435 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SF3B2Q13435 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SF3B2Q13435 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SF3B2Q13435 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SF3B2Q13435 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SF3B2Q13435 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SF3B2Q13435 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SF3B2Q13435 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SF3B2Q13435 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SF3B2Q13435 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SF3B2Q13435 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SF3B2Q13435 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SF3B2Q13435 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SF3B2Q13435 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SF3B2Q13435 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SF3B2Q13435 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SF3B2Q13435 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SF3B2Q13435 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SF3B2Q13435 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SF3B2Q13435 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SF3B2Q13435 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SF3B2Q13435 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SF3B2Q13435 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SF3B2Q13435 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SF3B2Q13435 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SF3B2Q13435 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SF3B2Q13435 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
SF3B2Q13435 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SF3B2Q13435 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
SF3B2Q13435 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
SF3B2Q13435 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SF3B2Q13435 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SF3B2Q13435 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SF3B2Q13435 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SF3B2Q13435 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SF3B2Q13435 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
SF3B2Q13435 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SF3B2Q13435 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
SF3B2Q13435 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SF3B2Q13435 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SF3B2Q13435 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SF3B2Q13435 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SF3B2Q13435 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SF3B2Q13435 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SF3B2Q13435 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SF3B2Q13435 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SF3B2Q13435 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SF3B2Q13435 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SF3B2Q13435 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SF3B2Q13435 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SF3B2Q13435 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SF3B2Q13435 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SF3B2Q13435 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
SF3B2Q13435 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SF3B2Q13435 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SF3B2Q13435 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SF3B2Q13435 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SF3B2Q13435 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SF3B2Q13435 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SF3B2Q13435 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SF3B2Q13435 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SF3B2Q13435 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
SF3B2Q13435 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SF3B2Q13435 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SF3B2Q13435 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SF3B2Q13435 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SF3B2Q13435 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SF3B2Q13435 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SF3B2Q13435 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SF3B2Q13435 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SF3B2Q13435 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SF3B2Q13435 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SF3B2Q13435 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
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