Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATMQ13315 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATMQ13315 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ATMQ13315 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ATMQ13315 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATMQ13315 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATMQ13315 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATMQ13315 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATMQ13315 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATMQ13315 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATMQ13315 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATMQ13315 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATMQ13315 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATMQ13315 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATMQ13315 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATMQ13315 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ATMQ13315 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATMQ13315 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATMQ13315 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATMQ13315 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATMQ13315 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATMQ13315 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATMQ13315 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATMQ13315 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATMQ13315 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATMQ13315 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATMQ13315 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATMQ13315 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATMQ13315 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATMQ13315 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATMQ13315 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATMQ13315 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATMQ13315 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATMQ13315 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATMQ13315 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATMQ13315 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATMQ13315 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATMQ13315 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATMQ13315 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATMQ13315 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATMQ13315 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ATMQ13315 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATMQ13315 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATMQ13315 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATMQ13315 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATMQ13315 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATMQ13315 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATMQ13315 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATMQ13315 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ATMQ13315 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATMQ13315 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATMQ13315 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATMQ13315 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATMQ13315 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATMQ13315 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATMQ13315 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATMQ13315 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ATMQ13315 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ATMQ13315 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATMQ13315 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATMQ13315 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATMQ13315 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATMQ13315 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATMQ13315 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATMQ13315 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATMQ13315 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATMQ13315 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATMQ13315 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATMQ13315 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ATMQ13315 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ATMQ13315 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATMQ13315 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATMQ13315 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATMQ13315 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATMQ13315 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATMQ13315 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATMQ13315 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATMQ13315 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ATMQ13315 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATMQ13315 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATMQ13315 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATMQ13315 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATMQ13315 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATMQ13315 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ATMQ13315 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ATMQ13315 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATMQ13315 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATMQ13315 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATMQ13315 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATMQ13315 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATMQ13315 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATMQ13315 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATMQ13315 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATMQ13315 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATMQ13315 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATMQ13315 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATMQ13315 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATMQ13315 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ATMQ13315 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATMQ13315 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
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