Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTGDRQ13258 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTGDRQ13258 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTGDRQ13258 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTGDRQ13258 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PTGDRQ13258 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PTGDRQ13258 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTGDRQ13258 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTGDRQ13258 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTGDRQ13258 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTGDRQ13258 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTGDRQ13258 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTGDRQ13258 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTGDRQ13258 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTGDRQ13258 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTGDRQ13258 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PTGDRQ13258 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTGDRQ13258 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTGDRQ13258 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
PTGDRQ13258 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PTGDRQ13258 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PTGDRQ13258 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTGDRQ13258 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTGDRQ13258 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTGDRQ13258 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTGDRQ13258 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTGDRQ13258 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTGDRQ13258 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTGDRQ13258 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTGDRQ13258 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTGDRQ13258 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTGDRQ13258 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTGDRQ13258 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTGDRQ13258 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTGDRQ13258 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PTGDRQ13258 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTGDRQ13258 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTGDRQ13258 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTGDRQ13258 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTGDRQ13258 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTGDRQ13258 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTGDRQ13258 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTGDRQ13258 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTGDRQ13258 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTGDRQ13258 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTGDRQ13258 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTGDRQ13258 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTGDRQ13258 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTGDRQ13258 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTGDRQ13258 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PTGDRQ13258 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTGDRQ13258 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTGDRQ13258 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTGDRQ13258 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTGDRQ13258 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTGDRQ13258 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTGDRQ13258 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTGDRQ13258 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTGDRQ13258 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTGDRQ13258 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTGDRQ13258 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTGDRQ13258 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTGDRQ13258 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTGDRQ13258 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTGDRQ13258 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTGDRQ13258 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTGDRQ13258 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTGDRQ13258 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTGDRQ13258 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTGDRQ13258 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTGDRQ13258 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PTGDRQ13258 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTGDRQ13258 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTGDRQ13258 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTGDRQ13258 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTGDRQ13258 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PTGDRQ13258 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTGDRQ13258 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTGDRQ13258 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTGDRQ13258 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTGDRQ13258 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTGDRQ13258 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTGDRQ13258 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTGDRQ13258 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTGDRQ13258 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTGDRQ13258 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTGDRQ13258 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTGDRQ13258 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTGDRQ13258 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTGDRQ13258 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTGDRQ13258 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTGDRQ13258 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PTGDRQ13258 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTGDRQ13258 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTGDRQ13258 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTGDRQ13258 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PTGDRQ13258 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTGDRQ13258 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTGDRQ13258 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PTGDRQ13258 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
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